More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2604 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  61.3 
 
 		 233 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.09 
 
 		 232 aa  274  8e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  58.02 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  58.02 
 
 		 246 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  58.02 
 
 		 246 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.48 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  57.26 
 
 		 297 aa  268  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  58.72 
 
 		 248 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  58.3 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  58.3 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  58.3 
 
 		 263 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.87 
 
 		 243 aa  264  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  58.3 
 
 		 251 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  57.45 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  56.6 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  58.72 
 
 		 251 aa  262  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  58.97 
 
 		 251 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  55.8 
 
 		 230 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  54.75 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  49.12 
 
 		 231 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  51.35 
 
 		 239 aa  226  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.56 
 
 		 231 aa  222  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.56 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  50.45 
 
 		 222 aa  221  8e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 235 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  49.15 
 
 		 250 aa  214  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 230 aa  211  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  51.09 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  51.11 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.18 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 244 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  47.7 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.72 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.23 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  51.11 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 234 aa  194  8.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.23 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.61 
 
 		 235 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 229 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.2 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  51.35 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 237 aa  189  4e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.19 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  44.03 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  39.46 
 
 		 229 aa  186  4e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 237 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  40.6 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.6 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  40.6 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  40.6 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  40.6 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  40.6 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 264 aa  185  6e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 230 aa  185  7e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.59 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.17 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.75 
 
 		 279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.26 
 
 		 231 aa  183  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 238 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.8 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  41.05 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 321 aa  181  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.95 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 261 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  41.05 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  45.29 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  41.05 
 
 		 235 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  44.8 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 222 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.35 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  41.05 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  41.05 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  39.74 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  41.05 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>