More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0867 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.27 
 
 		 254 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.73 
 
 		 264 aa  278  8e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  56.47 
 
 		 260 aa  274  7e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.37 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  55.78 
 
 		 255 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 277 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  48.69 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.63 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  49.8 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  47.28 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  47.28 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  46.91 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  46.91 
 
 		 251 aa  201  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  47.7 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  47.7 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  47.11 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.44 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 263 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  46.86 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  54.31 
 
 		 200 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 251 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  46.69 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.22 
 
 		 231 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  45.68 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.53 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  46.25 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.76 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.15 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  43.55 
 
 		 231 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 240 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 228 aa  168  7e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.19 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  42.74 
 
 		 231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.1 
 
 		 222 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  41 
 
 		 235 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.84 
 
 		 237 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  37.76 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  37.86 
 
 		 230 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.76 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  38.43 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  39.43 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.83 
 
 		 226 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  38.62 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  39.41 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.57 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  41.08 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.05 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  38.62 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.15 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.75 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  37.04 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.55 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.63 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  36.25 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  39.33 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  39.51 
 
 		 232 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  36.84 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  41.77 
 
 		 228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  35.92 
 
 		 228 aa  152  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  39.36 
 
 		 229 aa  151  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  39.75 
 
 		 236 aa  151  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  37.8 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1612  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00249249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  40.51 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.27 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  43.39 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  35.71 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  35.17 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  35.17 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>