More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1612 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1612  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00249249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4990  two component transcriptional regulator  62.06 
 
 		 228 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.866601  hitchhiker  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3904  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.25 
 
 		 230 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4477  response regulator receiver  59.68 
 
 		 228 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0949  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.89 
 
 		 252 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  45.71 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.16 
 
 		 239 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09580  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.95 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.63 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.9 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.96 
 
 		 242 aa  185  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  43.27 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.94 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 235 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7562  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.29 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.67 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1221  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.3 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.655279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 232 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.37 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.17 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  48.95 
 
 		 241 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  45.45 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.08 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  44.94 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1230  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.32 
 
 		 254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.53 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 225 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.93 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  46.5 
 
 		 228 aa  178  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  48.35 
 
 		 246 aa  178  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1256  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein PhoP  40.24 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  42.45 
 
 		 225 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.08 
 
 		 227 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  45.34 
 
 		 228 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.27 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.57 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.15 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 229 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.27 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.27 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  40.41 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.35 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.91 
 
 		 237 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.94 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.68 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  44.86 
 
 		 227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  47.11 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  47.52 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  47.11 
 
 		 244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  39.18 
 
 		 228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  47.52 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.09 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  46.69 
 
 		 233 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  44.08 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  39.18 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.34 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  45.27 
 
 		 228 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.49 
 
 		 225 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.75 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0596  response regulator receiver domain protein  41.42 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  41.15 
 
 		 239 aa  171  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  38.93 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  41.15 
 
 		 239 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  47.52 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 229 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 321 aa  169  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 242 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.08 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.53 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  40.24 
 
 		 230 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.31 
 
 		 222 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  45.53 
 
 		 229 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  42.91 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  44.21 
 
 		 297 aa  168  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.51 
 
 		 234 aa  168  9e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01481  two-component response regulator  40.78 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  45.04 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0707  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 227 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.598521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  45.04 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  37.14 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>