More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0305 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  99.15 
 
 		 235 aa  470  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  53.19 
 
 		 234 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  53.25 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  52.81 
 
 		 238 aa  240  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  51.95 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  51.95 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  51.95 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  51.95 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  48.68 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  48.31 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  49.16 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  49.16 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  49.16 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  46.84 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  48.74 
 
 		 236 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  45.53 
 
 		 288 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 240 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  47.88 
 
 		 252 aa  218  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  47.88 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 245 aa  215  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  44.26 
 
 		 240 aa  215  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  47.46 
 
 		 236 aa  215  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  48.91 
 
 		 247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 244 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.68 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  44.26 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  46.98 
 
 		 238 aa  212  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01694  two component response regulator transcription regulator protein  46.32 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  44.68 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  44.68 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  44.68 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  44.44 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  43.67 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  44.44 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  46.75 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  46.52 
 
 		 234 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  44.21 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  43.78 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  46.96 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  46.38 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 245 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.89 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  43.67 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4494  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  42.86 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0154  response regulator receiver protein  41.1 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.13097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.67 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 251 aa  189  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4408  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763742 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0097  hypothetical protein  44.07 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0268047  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.49 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0871  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1352  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1334  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 241 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  0.126015 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1261  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1236  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 241 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.178062  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  42.24 
 
 		 233 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  43.17 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3280  DNA-binding response regulator  42.42 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000001291  hitchhiker  0.0000698043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  42.67 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  43.15 
 
 		 246 aa  185  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 279 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 237 aa  184  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>