More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1781 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  71.57 
 
 		 260 aa  271  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  71.35 
 
 		 255 aa  261  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.18 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.82 
 
 		 254 aa  201  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  54.31 
 
 		 250 aa  198  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.04 
 
 		 248 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  46.01 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  47.4 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.16 
 
 		 320 aa  154  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 265 aa  154  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.86 
 
 		 277 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  45.69 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  41.15 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  41.15 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  56.3 
 
 		 378 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 232 aa  137  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  42.63 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 263 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.94 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 263 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 263 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.41 
 
 		 237 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  41.97 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  42.93 
 
 		 248 aa  132  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.62 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.89 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  52.76 
 
 		 371 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.24 
 
 		 243 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 251 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  41.45 
 
 		 233 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3500  response regulator receiver  50.85 
 
 		 356 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  37.37 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  38.92 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  40.22 
 
 		 265 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 251 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  40.22 
 
 		 265 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 251 aa  128  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.83 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.21 
 
 		 244 aa  125  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 251 aa  125  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.99 
 
 		 239 aa  124  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.9 
 
 		 125 aa  124  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  37.37 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 246 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  40.46 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.07 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 230 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3261  response regulator receiver  47.15 
 
 		 295 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  40.34 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  36.79 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  39.31 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  40.22 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  40.22 
 
 		 246 aa  118  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  38.95 
 
 		 245 aa  118  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.67 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2625  two component transcriptional regulator  38.17 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000561273 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 235 aa  117  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 236 aa  117  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.2 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  38.34 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.79 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.34 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 243 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0354  DNA-binding response regulator  34.21 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000041064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  37.7 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  37.57 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  39.69 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.62 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.21 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.27 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  30.1 
 
 		 240 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  30.1 
 
 		 240 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 240 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  36.41 
 
 		 241 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1527  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.255733  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  40.11 
 
 		 246 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  40.11 
 
 		 246 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.98 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  38.8 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4371  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.33 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  35.8 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 222 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.27 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1625  DNA-binding response regulator CsrR  33.16 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3473  DNA-binding response regulator  31.67 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  38.25 
 
 		 228 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1985  DNA-binding response regulator  32.22 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 321 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2869  two component transcriptional regulator  36.81 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>