More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0675 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  54.77 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  54.51 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  52.56 
 
 		 237 aa  241  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  52.34 
 
 		 237 aa  241  1e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4408  two component transcriptional regulator  55.13 
 
 		 242 aa  231  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0763742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  51.29 
 
 		 239 aa  215  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  50.65 
 
 		 238 aa  215  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  48.1 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  49.79 
 
 		 236 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  47.68 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  49.15 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.57 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  45.27 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  49.79 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 232 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.29 
 
 		 234 aa  204  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  46.06 
 
 		 238 aa  204  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  47.21 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  46.69 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  46.69 
 
 		 240 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  47.64 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  44.68 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  45.76 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  49.57 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  43.15 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 235 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  50 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01694  two component response regulator transcription regulator protein  45.34 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  48.1 
 
 		 233 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  46.78 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  46.78 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  46.78 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 233 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  46.69 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  43.51 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.86 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3142  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  49.59 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 230 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  41.42 
 
 		 252 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0151  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3280  DNA-binding response regulator  44.1 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000001291  hitchhiker  0.0000698043 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 240 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  43.39 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.78 
 
 		 231 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  38.75 
 
 		 236 aa  185  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0208  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.56 
 
 		 247 aa  182  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  42.56 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  41.98 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7054  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.13 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1280  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6551  two component transcriptional regulator  41.6 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  43.35 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 231 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6157  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0448783 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.06 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  42.45 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  41.6 
 
 		 257 aa  176  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  42.04 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  41.56 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.55 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 237 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>