More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_01450 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  100 
 
 		 320 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.9 
 
 		 254 aa  235  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.05 
 
 		 264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  41.83 
 
 		 255 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.08 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3500  response regulator receiver  58.87 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.23 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  33.44 
 
 		 251 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  40.56 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  55.88 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  56.12 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  48 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  50.76 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3261  response regulator receiver  33.99 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  51.26 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  51.26 
 
 		 244 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  47.58 
 
 		 371 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.72 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 378 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  46.32 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  45.59 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  47.33 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  45.24 
 
 		 231 aa  122  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 237 aa  122  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  42.18 
 
 		 297 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  48.74 
 
 		 251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  47.86 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.83 
 
 		 231 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4363  osmolarity response regulator  30.82 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  45.86 
 
 		 229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  29.93 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  28.25 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1584  osmolarity response regulator  31.05 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.131787  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3153  osmolarity response regulator  30.39 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.86 
 
 		 125 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.816358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2500  osmolarity response regulator  30.39 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.62 
 
 		 239 aa  113  5e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  30.1 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.62 
 
 		 222 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 229 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.2 
 
 		 234 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  44.72 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3492  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 160 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 246 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.09 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.17 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  42.4 
 
 		 230 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2868  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.61 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.133304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  30.16 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2228  two component transcriptional regulator  44.19 
 
 		 222 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00319429  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 229 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0969  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.165699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  28.38 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  27.51 
 
 		 233 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  29.51 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  30.16 
 
 		 245 aa  106  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4011  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.53 
 
 		 236 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0268606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.6 
 
 		 235 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  42.75 
 
 		 229 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  41.79 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7562  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.52 
 
 		 273 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.320599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4211  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.85 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  27.72 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4321  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.85 
 
 		 219 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0131168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  27.83 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  28.3 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  28.3 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.65 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2972  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  45.61 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 232 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3305  DNA-binding response regulator BaeR  40.44 
 
 		 232 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.304306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1612  two component transcriptional regulator  33 
 
 		 259 aa  103  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00249249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 237 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 227 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 227 aa  103  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.53 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 242 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  38.84 
 
 		 229 aa  102  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  28.25 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  27.83 
 
 		 241 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  26.37 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  40.6 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5611  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.68 
 
 		 235 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.736991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 230 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>