More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0437 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0437  response regulator receiver protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  56.15 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  56.33 
 
 		 236 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  53.28 
 
 		 232 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  53.28 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  53.71 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  52.84 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  52.4 
 
 		 232 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  55.9 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  52.4 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.97 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  49.79 
 
 		 239 aa  228  7e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  50.87 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  51.53 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  49.36 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  50.66 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 238 aa  223  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  48.71 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  53.28 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  46.72 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  45.49 
 
 		 237 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  44.49 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  46.72 
 
 		 235 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  45.02 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  42.98 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1032  response regulator  43.64 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0894814  normal  0.523068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  42.13 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  41.23 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  41.28 
 
 		 234 aa  189  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  40.85 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0473  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.6 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  41.23 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  40.43 
 
 		 234 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 241 aa  184  9e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1783  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3142  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.237256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4369  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0241221  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4886  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000459632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.2 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  41.2 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4939  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 242 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795324  unclonable  0.0000173858 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5349  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.656877  normal  0.0838777 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3429  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.941234  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.1 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  43.91 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0752  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 236 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0109076 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0031  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248418  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0844  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  41.3 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0815  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.576858  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2191  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0936  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1592  DNA-binding response regulator  44.83 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  39.5 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  41.48 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  39.26 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.26 
 
 		 240 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  41.63 
 
 		 243 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3677  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.470907 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  41.48 
 
 		 288 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  44.16 
 
 		 238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  41.48 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  41.48 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  41.48 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  40.43 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  41.95 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  40.77 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  40.77 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.84 
 
 		 275 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  40.34 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  41.45 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>