More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1773 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 260 aa  514  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.58 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2937  two component transcriptional regulator  67.73 
 
 		 255 aa  332  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.511337  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.98 
 
 		 254 aa  278  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  56.47 
 
 		 250 aa  274  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1781  response regulator receiver protein  71.57 
 
 		 200 aa  271  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110514  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0854  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.33 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0313558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2906  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3656  two component transcriptional regulator  44.85 
 
 		 275 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2050  response regulator receiver  47.95 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2924  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.79 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2604  response regulator receiver  44.03 
 
 		 244 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.88392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4233  response regulator receiver  44.03 
 
 		 244 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2935  two component transcriptional regulator  44.31 
 
 		 263 aa  181  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 251 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2905  two component transcriptional regulator  44.31 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2949  two component transcriptional regulator  44.31 
 
 		 263 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1834  two component transcriptional regulator  43.21 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.131317  normal  0.194802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  43.8 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  43.8 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4566  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.611556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  43.39 
 
 		 251 aa  175  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3887  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.243105 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  43.21 
 
 		 233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2838  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.692986  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2828  response regulator receiver  42.74 
 
 		 231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.87 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.555413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 246 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 246 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.04 
 
 		 232 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  39.67 
 
 		 231 aa  168  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 229 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.56 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  42.51 
 
 		 240 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  39.92 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3676  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.32 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  40.82 
 
 		 229 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2207  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.16 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.49 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04920  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  40.57 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 228 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2939  response regulator receiver  40.41 
 
 		 232 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  37.86 
 
 		 227 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2259  response regulator protein  39.09 
 
 		 288 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  39.52 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1019  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.79357  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0934  DNA-binding response regulator  39.09 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.273948  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2454  response regulator receiver  39.27 
 
 		 334 aa  152  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.811467  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.6 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.68 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  38.17 
 
 		 228 aa  150  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  38.08 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 236 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.85 
 
 		 219 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  36.1 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0259  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.74 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 237 aa  148  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.76 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  36.95 
 
 		 229 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1739  DNA-binding response regulator  38.93 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.203383  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 236 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  36.51 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.45 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  34.68 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1517  DNA-binding response regulator  38.11 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.184346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1144  DNA-binding response regulator  38.11 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7254  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.122444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  35.41 
 
 		 236 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0096  DNA-binding response regulator  38.11 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0972666  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6985  two component transcriptional regulator  39.36 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0162975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.25 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 236 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.75 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.76 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  30.99 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  30.99 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0510  two component transcriptional regulator  36.14 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1681  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0956507  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  33.07 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.8 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01450  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.14 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.610434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3064  response regulator transcription regulator protein  37.65 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.38417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>