More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05980  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  100 
 
 		 230 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.553702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6380  two component transcriptional regulator, winged helix family  79.04 
 
 		 223 aa  309  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654273  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  67.97 
 
 		 226 aa  274  7e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1046  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.39 
 
 		 230 aa  265  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0213528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.72 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  60.7 
 
 		 222 aa  245  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  61.23 
 
 		 222 aa  245  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  59.83 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.47 
 
 		 223 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.26 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1844  response regulator receiver  62.88 
 
 		 224 aa  234  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0160507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.97 
 
 		 240 aa  231  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.01 
 
 		 226 aa  228  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.87 
 
 		 230 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.12 
 
 		 227 aa  224  8e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.71 
 
 		 227 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.02 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.02 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.93 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  47.64 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  45.06 
 
 		 226 aa  187  9e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.66 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  47.44 
 
 		 229 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 236 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.78 
 
 		 226 aa  181  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  44.87 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  45.06 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  45.3 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  48.93 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  45.22 
 
 		 221 aa  178  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  44.83 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  44.87 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.3 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.34 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 230 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 220 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.98 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.15 
 
 		 237 aa  172  5e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.46 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  46.78 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  46.38 
 
 		 237 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.99 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.67 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2006  response regulator receiver  45.11 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.379718  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  46.55 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.3 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.48 
 
 		 226 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  42.55 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0896  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.07 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.232326  hitchhiker  0.00518822 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0753  putative response regulator  42.19 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19400  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.64 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0470356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.13 
 
 		 226 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.3 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  39.11 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1276  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  40.17 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  42.74 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3600  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.59 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284005 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 232 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02200  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.92 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1802  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.7 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.150286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1559  response regulator receiver  45.06 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  44.98 
 
 		 219 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0984  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.2 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0723779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 225 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  45.18 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.56 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2062  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 228 aa  164  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0133309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2741  winged helix family two component transcriptional regulator  41.84 
 
 		 250 aa  164  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0957275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>