254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0590 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0590  transcriptional regulatory protein, C  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  60 
 
 
229 aa  143  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1443  response regulator receiver  46.9 
 
 
228 aa  102  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 
230 aa  90.1  2e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0736  response regulator receiver  38.26 
 
 
236 aa  77.8  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1920  response regulator receiver  35.11 
 
 
226 aa  74.7  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1806  two-component response regulator  33.87 
 
 
220 aa  72  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  30 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.36 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  38.1 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  35.23 
 
 
216 aa  61.2  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1144  two component transcriptional regulator  29.57 
 
 
225 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0871  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 
214 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1837  DNA-binding response regulator  32.97 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.591446  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  31.86 
 
 
219 aa  59.3  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  32.97 
 
 
226 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1664  DNA-binding response regulator  32.97 
 
 
226 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.690265  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  27.96 
 
 
227 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1242  two component transcriptional regulator  32.81 
 
 
227 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.546498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  28.87 
 
 
222 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  36.59 
 
 
224 aa  55.1  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  29.9 
 
 
222 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  26.67 
 
 
223 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1458  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 
218 aa  54.3  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  32.61 
 
 
225 aa  53.9  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2785  response regulator  35.63 
 
 
223 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2853  DNA-binding response regulator  35.63 
 
 
223 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2825  response regulator  35.63 
 
 
223 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3067  DNA-binding response regulator  35.63 
 
 
223 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2139  response regulator receiver  32.56 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.99 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0544  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 
227 aa  50.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
220 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0705  response regulator receiver  31.25 
 
 
231 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00025775  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1579  response regulator receiver  30.95 
 
 
225 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.410227  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  28.57 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  28.28 
 
 
229 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  30.23 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.67 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1561  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1547  cytochrome c biogenesis protein  32.99 
 
 
220 aa  48.9  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1512  two component transcriptional regulator  36.99 
 
 
226 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0005  response regulator receiver domain-containing protein  25.66 
 
 
229 aa  48.5  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0566865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2846  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.570365  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1880  two component transcriptional regulator  37.21 
 
 
223 aa  48.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.34 
 
 
224 aa  48.1  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1214  DNA-binding response regulator KdpE  29.79 
 
 
237 aa  48.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000130813  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0471  two component transcriptional regulator  25.18 
 
 
221 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0337  putative response regulator ArlR  28.87 
 
 
215 aa  48.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1894  DNA-binding response regulator  28.79 
 
 
220 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0363  response regulator receiver  36.47 
 
 
228 aa  47.8  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  32.18 
 
 
231 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0768  two component transcriptional regulator  26.09 
 
 
220 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00104047  hitchhiker  0.00200685 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  25.18 
 
 
227 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2919  transcriptional regulatory protein-like protein  29.9 
 
 
604 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.104867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3964  two component transcriptional regulator  26.52 
 
 
219 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3511  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  28.03 
 
 
220 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  28 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2373  two component transcriptional regulator  35.05 
 
 
231 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0367191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 
217 aa  46.6  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6208  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.03 
 
 
226 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 
232 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  27.19 
 
 
217 aa  45.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 
223 aa  45.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2749  two component transcriptional regulator  26.51 
 
 
223 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.513844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8335  response regulator receiver protein  27.59 
 
 
239 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3209  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory proteinphoP  32.1 
 
 
220 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  28.06 
 
 
221 aa  45.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1883  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
247 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0448117  normal  0.830698 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1739  DNA-binding response regulator  30.34 
 
 
232 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0474  hypothetical protein  37.5 
 
 
373 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1224  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 
227 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0117785  hitchhiker  0.00926138 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  23.53 
 
 
220 aa  45.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1877  DNA-binding response regulator  30.34 
 
 
232 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  25.2 
 
 
221 aa  45.4  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2228  DNA-binding response regulator KdpE  33.33 
 
 
247 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1956  DNA-binding response regulator  30.34 
 
 
232 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1241  two component transcriptional regulator  33.72 
 
 
220 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2485  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.86 
 
 
243 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  32.58 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4983  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.91 
 
 
218 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  30.95 
 
 
230 aa  45.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 
226 aa  44.7  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  31.33 
 
 
220 aa  45.1  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  22.56 
 
 
226 aa  45.1  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  34.02 
 
 
231 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  26.44 
 
 
229 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  26.44 
 
 
230 aa  44.7  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  26.44 
 
 
229 aa  44.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.55 
 
 
237 aa  44.7  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  31.03 
 
 
229 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>