More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1512 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1512  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1561  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1824  two component transcriptional regulator  59.72 
 
 		 222 aa  280  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1433  two component transcriptional regulator  57.27 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1927  two component transcriptional regulator  55.09 
 
 		 232 aa  248  5e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0440711  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.51 
 
 		 237 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2643  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.23 
 
 		 235 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  164  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4704  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000673192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4484  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4319  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.17 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4330  alkaline phosphatase synthesis response regulator  39.17 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4833  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0982965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4714  DNA-binding response regulator PhoP  39.17 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  42.15 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4419  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2232  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  38.77 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.326614  normal  0.43086 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  38.75 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  38.75 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  39.45 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  39.45 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 238 aa  161  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 229 aa  161  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 240 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 228 aa  161  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.04 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.04 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.6 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.04 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  39.58 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.99 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  38.6 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  39.58 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  39.04 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  38.6 
 
 		 229 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  38.99 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.99 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.57 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  41.81 
 
 		 228 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  38.66 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  37.83 
 
 		 237 aa  157  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  38.57 
 
 		 226 aa  157  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0496  transcriptional regulator PhoB  38.16 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0435  transcriptional regulator PhoB  38.16 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2915  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.6 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0454  transcriptional regulator PhoB  38.16 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 227 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1815  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.101184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1181  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00335068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  37.72 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0441  transcriptional regulator PhoB  37.72 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  41.78 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  38.43 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.74 
 
 		 236 aa  155  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  39.46 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  39.04 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>