More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1464 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1464  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  427  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.286623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3787  transposase  58.18 
 
 		 229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 228 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  51.36 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 230 aa  207  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  51.82 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.64 
 
 		 230 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  50.23 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  50.23 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  49.77 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  50.68 
 
 		 232 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 231 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  48.64 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 		 230 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 231 aa  197  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.2 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 		 231 aa  194  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 230 aa  193  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.64 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  45.91 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04383  two-component system regulatory protein  49.32 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  49.1 
 
 		 234 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2990  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.839569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 232 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  48.88 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  49.33 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  49.33 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  49.33 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  49.33 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  49.33 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  49.33 
 
 		 232 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  49.33 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 		 231 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1510  two component transcriptional regulator  49.55 
 
 		 224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.963665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  49.77 
 
 		 229 aa  188  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 		 231 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  46.61 
 
 		 244 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4238  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.65 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.1 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2694  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 235 aa  184  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 233 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0051  two component transcriptional regulator  41.89 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030378 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0051  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0053  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 229 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  44.55 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  45.05 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.75 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.73 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.87 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4546  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.926448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0059  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 229 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000152099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 246 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  47.09 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1666  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.42 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.42 
 
 		 225 aa  177  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 230 aa  177  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  48.42 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  47.96 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0059  transcriptional regulatory protein KdpE  40.99 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  47.96 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  47.96 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  43.84 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 226 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  45.25 
 
 		 229 aa  175  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>