More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3557 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  100 
 
 
230 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  70.14 
 
 
231 aa  324  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  67.11 
 
 
226 aa  321  5e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  66.81 
 
 
234 aa  317  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  65.22 
 
 
229 aa  315  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  65.22 
 
 
229 aa  314  9e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 
232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  64.91 
 
 
232 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  64.47 
 
 
232 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  64.47 
 
 
232 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  64.47 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  64.47 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  64.47 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  64.47 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  64.47 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  64.47 
 
 
234 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.37 
 
 
234 aa  311  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.37 
 
 
234 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  64.29 
 
 
226 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  66.52 
 
 
231 aa  310  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  62.72 
 
 
232 aa  309  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  64.47 
 
 
232 aa  309  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  64.04 
 
 
232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  63.6 
 
 
232 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.16 
 
 
232 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  64.04 
 
 
232 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  64.04 
 
 
232 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  64.04 
 
 
232 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  60.96 
 
 
230 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  64.29 
 
 
225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  64.29 
 
 
225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  64.29 
 
 
225 aa  306  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  64.29 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.84 
 
 
225 aa  304  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.84 
 
 
225 aa  304  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.96 
 
 
225 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.96 
 
 
225 aa  300  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.96 
 
 
225 aa  300  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.96 
 
 
225 aa  300  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  63.51 
 
 
225 aa  299  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  63.51 
 
 
225 aa  299  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  68.28 
 
 
235 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.51 
 
 
225 aa  299  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  64.1 
 
 
236 aa  298  4e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  62.61 
 
 
225 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1666  two component transcriptional regulator  61.36 
 
 
230 aa  293  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.67 
 
 
230 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.33 
 
 
209 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.33 
 
 
209 aa  287  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  63.33 
 
 
209 aa  287  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  60.36 
 
 
225 aa  284  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  61.3 
 
 
229 aa  284  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  63 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.43 
 
 
248 aa  274  8e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  55.74 
 
 
247 aa  260  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  54.26 
 
 
231 aa  247  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 
231 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 
241 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  53.36 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  53.36 
 
 
231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  52.63 
 
 
230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  54.3 
 
 
230 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  52.91 
 
 
231 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 
230 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  51.53 
 
 
230 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  51.8 
 
 
227 aa  235  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  52.47 
 
 
230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  51.09 
 
 
230 aa  234  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  50.66 
 
 
231 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 
231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.25 
 
 
231 aa  231  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  52.25 
 
 
233 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
228 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 
225 aa  228  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  49.55 
 
 
226 aa  228  8e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 
228 aa  228  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 
232 aa  227  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 
228 aa  227  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 
230 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 
228 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  50.88 
 
 
230 aa  224  6e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  51.1 
 
 
228 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 
232 aa  224  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0450  two component transcriptional regulator  51.32 
 
 
232 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 
226 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.44 
 
 
232 aa  223  2e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  49.78 
 
 
232 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 
235 aa  222  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  50 
 
 
228 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 
231 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.12 
 
 
235 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.89 
 
 
237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0371836  normal  0.118342 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.66 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 
230 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.34 
 
 
235 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2379  two component transcriptional regulator  54.42 
 
 
250 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>