More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3144 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3144  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 226 aa  448  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.549897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2749  two component transcriptional regulator  56.82 
 
 		 223 aa  222  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.513844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 222 aa  174  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 222 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0919  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  44.95 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  43.78 
 
 		 235 aa  168  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 		 224 aa  168  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  44.95 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0440  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.747409  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 227 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3740  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.487084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 227 aa  165  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  43.05 
 
 		 225 aa  165  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.7 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2215  two component transcriptional regulator  46.4 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.5 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.638176 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 219 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2619  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  42.67 
 
 		 226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0057  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.18 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.18 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  40.18 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  43.32 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0034  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3146  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.66 
 
 		 218 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.149495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.99 
 
 		 231 aa  162  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  39.91 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 		 222 aa  161  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 225 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3932  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1638  two component transcriptional regulator  45.25 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.26 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0943  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0172896  normal  0.994999 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0057  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  42.01 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  38.56 
 
 		 235 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 228 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3075  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 220 aa  158  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0867071  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1948  response regulator receiver domain-containing protein  39.73 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.679676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 230 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 225 aa  157  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2430  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.81 
 
 		 227 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4683  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.81 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.222547  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3680  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.81 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2201  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.153982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>