More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0871 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0871  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 214 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4623  DNA-binding response regulator  34.86 
 
 		 225 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3798  two component transcriptional regulator  34.86 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  34.1 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0381  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3011  two component transcriptional regulator  34.11 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4007  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.56 
 
 		 246 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  36.07 
 
 		 221 aa  137  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.29 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4196  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4328  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0353  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 220 aa  135  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 236 aa  134  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3577  two component transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  34.84 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  35.14 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  35.45 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2296  response regulator receiver domain-containing protein  31.65 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621544 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  35.93 
 
 		 227 aa  131  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 222 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  32.41 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  31.67 
 
 		 272 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.4 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  33.8 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5866  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.14 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003617  DNA-binding response regulator  34.56 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.831618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  31.22 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.64 
 
 		 218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.55 
 
 		 225 aa  128  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.08 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  34.1 
 
 		 232 aa  128  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.94 
 
 		 219 aa  128  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  33.94 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1561  two component transcriptional regulator  36.74 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1512  two component transcriptional regulator  36.74 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.94 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  33.94 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.94 
 
 		 219 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 226 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2929  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 230 aa  127  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0551332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 235 aa  127  9.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0124  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  32.42 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  33.02 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3203  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.94 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  34.1 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1228  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.28 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.169339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453489  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3011  two component transcriptional regulator  32.73 
 
 		 222 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  0.458357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  33.8 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 236 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0373  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.73 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  33.49 
 
 		 219 aa  126  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05570  hypothetical protein  33.78 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  31.8 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.58 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  35.02 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.82 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2543  putative two-component response regulator  33.33 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0177943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  38.29 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  36.04 
 
 		 229 aa  125  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  35.43 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  35.35 
 
 		 228 aa  124  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4163  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3155  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3429  DNA-binding transcriptional regulator QseB  34.4 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0732  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1974  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  31.65 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.667108 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29730  putative two-component response regulator  32.87 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  34.7 
 
 		 291 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>