More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0819 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 246 aa  501  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0818  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.501115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.95 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2788  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 232 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.471427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1138  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564511  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 		 236 aa  165  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2799  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 224 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.75 
 
 		 234 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1916  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.400732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1848  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 236 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0065624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08510  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.29 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103906  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2599  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.05 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1879  DNA-binding response regulator  37.34 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000557668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.44 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 		 236 aa  158  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0768  two component signal transduction response regulator  36.91 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000566504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.86 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 242 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2389  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0687652  decreased coverage  0.0000973314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0467  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2384  two component transcriptional regulator  36.02 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1291  two component transcriptional regulator  36.91 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000572556  hitchhiker  0.0000375019 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.06 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26531  two-component response regulator  34.75 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  35.62 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0507  two component transcriptional regulator  36.91 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1334  two component transcriptional regulator  37.71 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4966  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196418 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1500  two component transcriptional regulator  35.17 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1155  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.66 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.560017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0271  osmolarity response regulator  37.61 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.37 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02061  two-component response regulator  35.17 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.540525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0835  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1871  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.105791  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.23 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.83 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  37.75 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  38.26 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  37.55 
 
 		 230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  37.34 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.73 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2880  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.344114  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0136  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01511  two-component response regulator  35.59 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.6 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1157  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 233 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2762  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.89 
 
 		 225 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.6 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.8 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01531  two-component response regulator  35.59 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  37.67 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 247 aa  151  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2353  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0794558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2302  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.68 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0925  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.42 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0932454  normal  0.0109566 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01621  two-component response regulator  35.59 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.367767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3821  response regulator receiver  36.84 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2763  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137809  hitchhiker  0.000236663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  37.24 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1304  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2629  two component signal transduction response regulator  38.5 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.35 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1414  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.83 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  37.66 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0328  DNA-binding response regulator OmpR  36.48 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3400  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105495  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 244 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1321  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0200617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3274  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2924  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 234 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.470238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>