More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0337 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0337  putative response regulator ArlR  100 
 
 		 215 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2088  transcriptional regulator domain protein  32.87 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.99052  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2090  transcriptional regulator domain protein  34.88 
 
 		 220 aa  118  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1180  response regulator receiver  27.27 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0743  response regulator receiver  24.65 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1272  response regulator receiver  26.17 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2004  response regulator receiver  25.45 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2476  two component transcriptional regulator  27.93 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.210757  normal  0.512741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03384  response regulator  27.15 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000742618  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0625  two component transcriptional regulator  27.78 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1931  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2190  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.79 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  29.38 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0377  DNA-binding response regulator  30.38 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.306284  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  28.87 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3235  DNA-binding response regulator  29.17 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  24.89 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  24.89 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  25.81 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17800  response regulator, transcriptional regulatory protein (two-component), ColR  26.91 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435874  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4952  putative two-component response regulator  24.89 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4374  DNA-binding response regulator ColR  25.99 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  28.87 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4070  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  25.99 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0290724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4498  two component transcriptional regulator  26.87 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000234919 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24350  putative two-component response regulator  25.68 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  27.11 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2062  putative two-component response regulator  25.34 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.658393  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  27.11 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  28.7 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  25.23 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  24.2 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2999  DNA-binding response regulator  28.12 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.227145  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3229  DNA-binding response regulator  28.12 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  24.2 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3589  two component transcriptional regulator  24.2 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0901  winged helix family two component transcriptional regulator  25.99 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4486  two component transcriptional regulator  25.99 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0969  two component transcriptional regulator  25.99 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0940  two component transcriptional regulator  25.99 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2027  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.21 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.51435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0851  two component transcriptional regulator  26.34 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.87 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1726  two component signal transduction response regulator  28.51 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000605334  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  24.2 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.51 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  26.22 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  26.39 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  26.46 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4347  two component transcriptional regulator  25.78 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0871  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.27 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000143126  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1233  DNA-binding response regulator  27.43 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0842153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  26.24 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  24.2 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.22 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  23.04 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56950  putative two-component response regulator  24.44 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0989  DNA-binding response regulator ArlR  28.74 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110636  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  24.22 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  25.12 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  28.41 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  24.66 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  23.74 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0247  two component transcriptional regulator  25.73 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  26.27 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.32 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  23.85 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0500  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 245 aa  62.4  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000138983  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  28.41 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  27.91 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.44 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  27.35 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.53 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  27.53 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0722  response regulator receiver domain-containing protein  23.57 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0554017  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1927  two component transcriptional regulator  37.4 
 
 		 232 aa  61.6  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0440711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  28.41 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2752  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  29.21 
 
 		 799 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.89 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.12 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0286  two component transcriptional regulator  23.53 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13160  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  25.34 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.719024 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.73 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0503  two component transcriptional regulator  25.11 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  28.65 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.89 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.88 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  26.55 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  21.88 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00402  putative two component response regulator transcription regulator protein  27.15 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00497843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0448  response regulator receiver  29.14 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000838603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3910  two component transcriptional regulator  27.7 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.598174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  25.46 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1354  two comoponent transcriptional regulator  25.76 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12417  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1362  DNA-binding response regulator  28.69 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.7 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0802  two component transcriptional regulator  30.94 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>