More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1953 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  70.98 
 
 		 224 aa  350  7e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  70.98 
 
 		 224 aa  350  7e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3249  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 225 aa  220  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 225 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  47.93 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2949  response regulator  46.61 
 
 		 225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.028063  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  47.03 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2977  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3258  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  47.93 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  47.47 
 
 		 225 aa  218  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  46.58 
 
 		 254 aa  218  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3272  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0802882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3279  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  218  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  46.58 
 
 		 254 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  47 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 		 254 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  46.12 
 
 		 228 aa  214  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 224 aa  194  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.45 
 
 		 228 aa  188  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 232 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  39.09 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  174  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 231 aa  174  9e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  40.62 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 231 aa  172  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  41.15 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 230 aa  170  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  40.55 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 236 aa  168  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  39.27 
 
 		 228 aa  168  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  37.83 
 
 		 234 aa  167  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  39.27 
 
 		 228 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  36.96 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 		 256 aa  165  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 234 aa  165  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  38.05 
 
 		 227 aa  165  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 225 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 229 aa  164  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  38.67 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.09 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  38.36 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.12 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.3 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.67 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  38.12 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  38.5 
 
 		 238 aa  161  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  37.78 
 
 		 229 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 228 aa  161  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  37.44 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1954  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000155813  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.33 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  35.91 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>