More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0123 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  46.36 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 224 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3249  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  37.9 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3258  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 225 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2977  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3272  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0802882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  41.28 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3279  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2949  response regulator  40 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.028063  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1773  DNA-binding response regulator  38.81 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  40 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  40.83 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  40.83 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  39.01 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  40.37 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  40.37 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 		 224 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  39.63 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  39.63 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  39.63 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  39.63 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  39.63 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  36.82 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 232 aa  155  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 230 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 226 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.57 
 
 		 225 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0993  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.24 
 
 		 237 aa  154  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0618  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0651  DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  37.61 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0708  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.675964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 		 232 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0719  DNA-binding response regulator  39.19 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 232 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0563  response regulator  38.74 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0562  response regulator  38.74 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.1 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3453  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0260  response regulator receiver protein  33.48 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0565  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0780  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 225 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 229 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.9 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4261  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 224 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.906422  normal  0.0109867 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  36.8 
 
 		 233 aa  148  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3369  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.881494  normal  0.845013 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5055  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.05 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4222  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.43 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.22 
 
 		 229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01810  transcriptional regulatory protein  37.1 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.44 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  35.43 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.04 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  34.84 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  34.93 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5113  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00211772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5504  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 242 aa  145  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4651  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 225 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00217543  unclonable  3.82242e-26 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0547  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 224 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5379  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5353  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4959  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000160223  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 225 aa  144  9e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4944  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0109954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0604  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00704602  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0632  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>