More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS3028 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  100 
 
 
225 aa  456  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3258  DNA-binding response regulator  100 
 
 
225 aa  456  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  100 
 
 
225 aa  456  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3272  DNA-binding response regulator  99.56 
 
 
225 aa  454  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0802882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3279  DNA-binding response regulator  99.56 
 
 
225 aa  454  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  99.56 
 
 
225 aa  454  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2949  response regulator  99.56 
 
 
225 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.028063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3249  DNA-binding response regulator  99.56 
 
 
225 aa  455  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  99.11 
 
 
225 aa  453  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2977  two component transcriptional regulator  98.65 
 
 
223 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.3 
 
 
224 aa  252  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  54.09 
 
 
225 aa  247  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  52.04 
 
 
254 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  52.49 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  52.49 
 
 
254 aa  241  6e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 
225 aa  241  7e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  52.73 
 
 
225 aa  241  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  52.27 
 
 
225 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  52.97 
 
 
225 aa  240  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  52.49 
 
 
254 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  52.49 
 
 
228 aa  240  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.11 
 
 
225 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  48.42 
 
 
224 aa  227  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 
224 aa  227  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
224 aa  225  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 
224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 
228 aa  205  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.08 
 
 
236 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 
237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 
223 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 
228 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 
223 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 
230 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 
229 aa  186  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  43.69 
 
 
228 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  43.48 
 
 
241 aa  185  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  185  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 
227 aa  185  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 
256 aa  184  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 
230 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 
225 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 
229 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 
223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  42.22 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 
223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  41.78 
 
 
223 aa  181  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 
223 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 
223 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 
224 aa  180  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 
223 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 
223 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 
223 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.26 
 
 
233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 
241 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  41.3 
 
 
241 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 
238 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  42.17 
 
 
250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  42.17 
 
 
250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  42.17 
 
 
238 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  42.17 
 
 
238 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  42.17 
 
 
238 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  42.17 
 
 
250 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  42.17 
 
 
238 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  42.17 
 
 
238 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  42.17 
 
 
238 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 
231 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 
230 aa  176  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 
225 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 
230 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
231 aa  176  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 
225 aa  175  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 
223 aa  174  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.15 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.17 
 
 
232 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 
226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.35 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 
232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 
231 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 
231 aa  172  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2674  DNA-binding response regulator  41.33 
 
 
232 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00069138  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 
232 aa  172  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1689  response regulator  41.56 
 
 
232 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>