More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2977 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2977  two component transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  98.65 
 
 
225 aa  447  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  98.65 
 
 
225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3258  DNA-binding response regulator  98.65 
 
 
225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2949  response regulator  98.21 
 
 
225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.028063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3249  DNA-binding response regulator  98.65 
 
 
225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  98.65 
 
 
225 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3272  DNA-binding response regulator  98.21 
 
 
225 aa  443  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0802882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3279  DNA-binding response regulator  98.21 
 
 
225 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  98.21 
 
 
225 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.3 
 
 
224 aa  251  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
225 aa  250  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 
254 aa  244  9e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  52.49 
 
 
254 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  53.42 
 
 
225 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  53.42 
 
 
225 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  52.94 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  52.73 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  53.42 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  52.94 
 
 
228 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  50.22 
 
 
224 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 
225 aa  226  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  47.96 
 
 
224 aa  224  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 
224 aa  224  6e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 
224 aa  219  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 
224 aa  219  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 
228 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 
228 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 
237 aa  201  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 
236 aa  197  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 
223 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 
230 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  43.04 
 
 
241 aa  185  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 
223 aa  185  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 
230 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
228 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 
227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 
229 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 
256 aa  182  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 
223 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 
225 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
230 aa  181  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  42.27 
 
 
223 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  42.27 
 
 
224 aa  181  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 
223 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  42.73 
 
 
223 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 
223 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 
230 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  42.27 
 
 
223 aa  180  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
229 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 
223 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 
227 aa  180  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  42.08 
 
 
223 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 
223 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  43.18 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.53 
 
 
233 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  40.87 
 
 
241 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 
241 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 
230 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 
231 aa  176  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 
230 aa  176  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 
238 aa  174  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1399  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 
238 aa  174  8e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.129694  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 
231 aa  174  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 
223 aa  174  9e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  41.15 
 
 
226 aa  174  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1569  DNA-binding response regulator ResD  41.3 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45334e-32 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1601  DNA-binding response regulator ResD  41.3 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.953648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  39.39 
 
 
238 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1637  DNA-binding response regulator ResD  41.3 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0246031  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1403  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000398651  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  40.45 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1531  DNA-binding response regulator ResD  41.3 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1386  DNA-binding response regulator ResD  41.3 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1359  response regulator  41.3 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1358  response regulator  41.3 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1497  DNA-binding response regulator ResD  41.3 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.862661  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3814  DNA-binding response regulator ResD  41.3 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.95849e-16 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2855  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000952101  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 
232 aa  172  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2617  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 
231 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.993672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  40.53 
 
 
231 aa  171  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 
226 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 
231 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0956  DNA-binding response regulator  37.95 
 
 
223 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.504019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  40.97 
 
 
231 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 
234 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 
230 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>