More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_2385 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2385  two component transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2431  response regulator receiver  100 
 
 
224 aa  464  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.721266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1953  DNA-binding response regulator  70.98 
 
 
224 aa  350  7e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2949  response regulator  48.87 
 
 
225 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.028063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3028  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 
225 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3261  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 
225 aa  227  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3258  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 
225 aa  227  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3272  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 
225 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0802882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3279  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 
225 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2001  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 
225 aa  227  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3013  response regulator  48.42 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120143  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3249  DNA-binding response regulator  48.42 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2977  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 
223 aa  224  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0131031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 
224 aa  221  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1824  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 
225 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  45.21 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  44.75 
 
 
225 aa  215  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  43.84 
 
 
225 aa  214  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  43.84 
 
 
225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1991  DNA-binding response regulator  43.78 
 
 
254 aa  211  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9362699999999994e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  43.78 
 
 
254 aa  211  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  43.32 
 
 
254 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  43.32 
 
 
228 aa  210  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  43.32 
 
 
254 aa  209  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1740  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 
225 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204942  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 
228 aa  196  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3138  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 
224 aa  188  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 
224 aa  188  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 
223 aa  185  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.71 
 
 
236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  40 
 
 
231 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.01 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 
225 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 
227 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 
238 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  40.99 
 
 
230 aa  171  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 
223 aa  170  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 
231 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 
229 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  40.79 
 
 
227 aa  169  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.9 
 
 
231 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.5 
 
 
234 aa  167  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 
232 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
228 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  39.04 
 
 
228 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  39.38 
 
 
228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 
231 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  38.12 
 
 
228 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  39.37 
 
 
245 aa  165  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 
233 aa  165  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  38.67 
 
 
230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 
228 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 
261 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.61 
 
 
226 aa  164  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  36.24 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.96 
 
 
223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  39.21 
 
 
228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 
223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1240  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 
227 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  38.64 
 
 
223 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
256 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 
224 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0170  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  38.5 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  39.65 
 
 
239 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  35.14 
 
 
236 aa  162  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 
229 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 
231 aa  161  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1397  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 
261 aa  161  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0231814  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.12 
 
 
229 aa  161  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 
232 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 
224 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 
236 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  38.18 
 
 
223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  37.73 
 
 
223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 
223 aa  161  9e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 
233 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 
223 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.18 
 
 
223 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 
232 aa  160  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  38.18 
 
 
223 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 
241 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.11 
 
 
225 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 
228 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 
237 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.33 
 
 
226 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  38.18 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  37.73 
 
 
223 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  36.96 
 
 
233 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 
228 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  38.16 
 
 
228 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>