More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2781 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2781  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  482  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  48.67 
 
 		 230 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.77 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.86 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.56 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  46.22 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  45.02 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1073  putative response regulator  45.61 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.09 
 
 		 226 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  45.98 
 
 		 229 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  44.89 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 231 aa  181  8.000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  47.09 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 226 aa  181  8.000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 228 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4718  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  44.69 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5185  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  44.69 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  42.24 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  45.22 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.59 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5257  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.69 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 230 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.22 
 
 		 234 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.43 
 
 		 230 aa  178  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 229 aa  178  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 227 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2339  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7423  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  45.95 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  42.98 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  44.14 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2522  response regulator receiver  38.96 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.661278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  42.29 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 228 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 234 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 231 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.98 
 
 		 229 aa  175  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 228 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6685  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.599421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4159  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.667277  normal  0.0359145 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.89 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  42.29 
 
 		 227 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  41.81 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 225 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  43.67 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 228 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  40.09 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 233 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 228 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 239 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 245 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4351  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.78 
 
 		 237 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 233 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1485  response regulator receiver  41.33 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.236897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.48 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 238 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  40.43 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4720  DNA-binding response regulator PhoP  41.05 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4699  DNA-binding response regulator PhoP  41.48 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  47.14 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  40.99 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 272 aa  170  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0539  DNA-binding response regulator PhoP  41.48 
 
 		 239 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>