More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0500 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0500  transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000138983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05736  positive response regulator for pho regulon  85.39 
 
 		 220 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000129  transcriptional regulator  85 
 
 		 220 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000110935  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0650  transcriptional regulator, response regulator  71.14 
 
 		 201 aa  303  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0973  transcriptional regulator  51.87 
 
 		 216 aa  214  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.8 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  42.2 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.67 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.26 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.52 
 
 		 226 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1572  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000784208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  43.05 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 235 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.82 
 
 		 244 aa  152  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  38.57 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 225 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.55 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000555295  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 231 aa  151  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 235 aa  151  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  38.12 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  38.96 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.04 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  37.67 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0130  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.848842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  37.67 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.82 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  37.05 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  38.53 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.29 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  38.53 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  38.01 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  38.84 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.1 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 236 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  38.63 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  38.63 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  38.63 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  38.63 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  38.63 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  38.63 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  38.63 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 239 aa  149  6e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.96 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6002  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1105  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  37.22 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 231 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1893  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5698  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  38.94 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  40.61 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1505  response regulator receiver  41.26 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.404603  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.74 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  38.22 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  39.01 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1461  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.29 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.616357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  36.16 
 
 		 229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2232  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.2 
 
 		 227 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.326614  normal  0.43086 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  36.16 
 
 		 229 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  36.94 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  37.84 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  41.07 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  38.7 
 
 		 230 aa  145  6e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 223 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>