More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1268 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1268  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 
229 aa  455  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.13 
 
 
231 aa  214  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1600  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 
224 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000237714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 
230 aa  201  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 
230 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3577  two component transcriptional regulator  40.71 
 
 
232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2316  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.21 
 
 
230 aa  197  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2387  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00115026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2631  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 
235 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0653315 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0769  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 
236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.83 
 
 
225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  43.86 
 
 
232 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0632  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 
236 aa  194  7e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.883969  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 
230 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0578  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 
240 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1288  two component transcriptional regulator  38.74 
 
 
238 aa  192  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2513  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 
225 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1491  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.39 
 
 
235 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2367  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 
235 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  40.09 
 
 
229 aa  191  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4913  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
231 aa  190  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.121364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  42.11 
 
 
230 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0253  DNA-binding response regulator PhoB  38.84 
 
 
229 aa  190  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
229 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0489  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 
228 aa  189  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 
226 aa  189  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
229 aa  189  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  40 
 
 
227 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0993  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.86 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4408  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0897949 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2550  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 
228 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0605198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.63 
 
 
226 aa  188  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.944339  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0880  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 
236 aa  188  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 
229 aa  188  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.91 
 
 
229 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0834  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.91 
 
 
265 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0108417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5261  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.44 
 
 
237 aa  188  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1597  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 
237 aa  187  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 
236 aa  187  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000906935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  39.91 
 
 
229 aa  187  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 
235 aa  187  9e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5606  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
229 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  38.05 
 
 
229 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  37.95 
 
 
229 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 
226 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  39.73 
 
 
233 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  39.73 
 
 
229 aa  186  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 
236 aa  186  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3413  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 
252 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.427436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5320  winged helix family two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
242 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
223 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5228  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.661336  normal  0.450139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0154  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 
229 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5367  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.400776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3105  DNA-binding response regulator PhoB  40.89 
 
 
232 aa  185  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0511  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  38.91 
 
 
234 aa  185  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.473137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0603  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 
233 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0519325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03440  putative DNA-binding response regulator PhoB  40.62 
 
 
229 aa  185  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004385  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.84 
 
 
229 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.29 
 
 
229 aa  185  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  39.29 
 
 
229 aa  185  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  39.29 
 
 
239 aa  185  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1846  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 
226 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6138  two-component response regulator PhoB  39.73 
 
 
229 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.99 
 
 
230 aa  185  5e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70750  two-component response regulator PhoB  39.73 
 
 
229 aa  185  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0772  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.48 
 
 
233 aa  185  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2143  phosphate regulon transcriptional regulatory protein Phob  39.19 
 
 
228 aa  185  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  40.71 
 
 
223 aa  185  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2457  response regulator homolog PhoB (phosphate regulon transcriptional regulatory protein)  39.29 
 
 
230 aa  185  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2693  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 
226 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.575064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  185  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2257  two component transcriptional regulator  38.81 
 
 
243 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.512842  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
223 aa  185  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  39.29 
 
 
229 aa  185  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
223 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  40.71 
 
 
223 aa  184  7e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2058  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  39.19 
 
 
228 aa  184  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.275433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  40.71 
 
 
223 aa  184  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 
238 aa  184  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  41.67 
 
 
237 aa  184  9e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 
223 aa  184  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48520  phosphate regulon response regulator; PhoB  38.43 
 
 
229 aa  184  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0667889  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.05 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  37.05 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  37.05 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  37.05 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  37.05 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  37.05 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2201  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.153982  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>