More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1039 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1039  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 222 aa  440  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2065  two component transcriptional regulator  78.7 
 
 		 221 aa  341  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0454664 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5125  two component response regulator  65.28 
 
 		 222 aa  291  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2615  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.16 
 
 		 229 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.507206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2283  two component transcriptional regulator, winged helix family  66.06 
 
 		 222 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  50.91 
 
 		 229 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 230 aa  232  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  50.91 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  51.85 
 
 		 224 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  50.93 
 
 		 225 aa  228  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0434  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.569156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.85 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4326  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  53.15 
 
 		 222 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0885545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1411  response regulator receiver  50 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1685  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 225 aa  224  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00118059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.39 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1407  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.54 
 
 		 225 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440596  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  52.53 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1187  two component transcriptional regulatory protein  49.55 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 225 aa  222  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  50.46 
 
 		 221 aa  222  4e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3187  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 229 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5130  OmpR/winged helix family two component transcriptional regulator  50.92 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.76336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  48.65 
 
 		 223 aa  221  8e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  221  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1585  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.346975  normal  0.0159834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.87 
 
 		 224 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4436  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 227 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.177006  normal  0.889846 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1311  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 220 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.821017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4171  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.88 
 
 		 225 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  48.18 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0928  two component transcriptional regulator  51.85 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3431  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.866455  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2228  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 235 aa  208  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3060  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3176  two component transcriptional regulator  51.39 
 
 		 223 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.987704  normal  0.0233237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3896  two component transcriptional regulator  54.13 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.253425  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4083  two component transcriptional regulator  51.58 
 
 		 223 aa  202  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5099  two component transcriptional regulator  49.1 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.620422  normal  0.120293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1885  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 221 aa  201  9e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4311  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0333339  normal  0.0442497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3765  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.22 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.757734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1830  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000334727  normal  0.705517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5573  two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.106335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3779  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0761961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1979  putative transcriptional regulator  43.06 
 
 		 219 aa  195  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0630  two component transcriptional regulator  48.85 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000549408  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4932  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.202515 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3156  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0570697 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003784  two-component system response regulator QseB  43.98 
 
 		 219 aa  189  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000147394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3772  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.701851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0241  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4487  DNA-binding response regulator  47.51 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3511  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1244  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000551267  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4595  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 224 aa  188  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1884  two component transcriptional regulator  45.5 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4114  response regulator receiver  46.12 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6194  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.61 
 
 		 222 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4482  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0240  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000039366 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3781  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02658  hypothetical protein  44.44 
 
 		 219 aa  187  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3303  response regulator receiver protein  44.55 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.19 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4694  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 221 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.73278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4404  winged helix family two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 221 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.656013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0239  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0239  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02297  response regulator in two-component regulatory system with PhoQ  42.73 
 
 		 224 aa  185  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0242  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0357  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 219 aa  184  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0245  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.33 
 
 		 219 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117592 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0588  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.44 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5304  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 221 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  41.44 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  45.74 
 
 		 222 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28580  Response regulator  44.7 
 
 		 221 aa  181  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29730  putative two-component response regulator  46.54 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0282  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.05 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0932199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2695  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 226 aa  180  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000581772  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1354  two comoponent transcriptional regulator  45.62 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3685  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2543  putative two-component response regulator  46.08 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0177943  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0616  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0199047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3414  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00145574  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02836  two-component system regulatory protein (response regulator) required for AvrXa21 activity R2 (raxR2)  43.98 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0615  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0124209  normal  0.327567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>