More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2322 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  100 
 
 
234 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  68.97 
 
 
234 aa  348  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  66.81 
 
 
235 aa  330  1e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  66.38 
 
 
235 aa  328  3e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  65.94 
 
 
235 aa  328  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  64.94 
 
 
235 aa  327  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  66.38 
 
 
235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  66.38 
 
 
235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  66.38 
 
 
235 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  65.5 
 
 
235 aa  325  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  64.94 
 
 
235 aa  324  7e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  64.63 
 
 
235 aa  322  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 
231 aa  322  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 
231 aa  322  4e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 
231 aa  322  4e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 
231 aa  322  4e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 
231 aa  322  4e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 
231 aa  322  4e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  63.32 
 
 
231 aa  321  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  62.88 
 
 
231 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  62.88 
 
 
231 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  63.32 
 
 
231 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 
231 aa  319  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.74 
 
 
232 aa  284  8e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  57.64 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  58.08 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  57.64 
 
 
235 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  57.64 
 
 
235 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  57.64 
 
 
235 aa  281  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
252 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  58.08 
 
 
235 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  56.77 
 
 
235 aa  277  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  53.48 
 
 
237 aa  270  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.57 
 
 
235 aa  245  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  44.34 
 
 
223 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  42.29 
 
 
224 aa  201  9e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  42.53 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 
224 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 
221 aa  190  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 
223 aa  190  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.81 
 
 
246 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.04 
 
 
226 aa  190  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  40.44 
 
 
232 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  43.5 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  41.7 
 
 
221 aa  181  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 
221 aa  181  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  39.91 
 
 
226 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 
226 aa  177  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  41.07 
 
 
225 aa  175  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 
222 aa  170  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 
223 aa  165  5e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  38.77 
 
 
223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 
225 aa  159  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 
226 aa  155  4e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 
242 aa  155  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.91 
 
 
230 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.96 
 
 
271 aa  149  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.56 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  35.09 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 
225 aa  145  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1558  phosphate regulon response regulator PhoB  34.96 
 
 
239 aa  145  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 
228 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 
228 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2709  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 
229 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000407229  decreased coverage  0.000000263688 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2777  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 
229 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  decreased coverage  0.000208697 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2879  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 
229 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000143261  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 
228 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2981  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  34.96 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000220801  hitchhiker  0.00121997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1364  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000657343  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1403  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00109837  normal  0.0219543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1378  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000291119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  36 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 
223 aa  144  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.07 
 
 
231 aa  144  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 
228 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 
228 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  34.8 
 
 
227 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.22 
 
 
237 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1296  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 
229 aa  143  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000460678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1074  response regulator receiver protein  34.07 
 
 
229 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000246777  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 
230 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 
234 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2590  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 
230 aa  142  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 
233 aa  142  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 
231 aa  141  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2768  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  34.51 
 
 
229 aa  141  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  35.32 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.91 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0031  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.11 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2688  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.56 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0901925  normal  0.494683 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.788201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>