More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_4677 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  479  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  98.7 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  98.7 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  98.7 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  98.7 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  99.13 
 
 		 231 aa  475  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  98.7 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  99.13 
 
 		 231 aa  475  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  98.27 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  98.27 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  93.94 
 
 		 231 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  62.45 
 
 		 234 aa  319  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  58.87 
 
 		 234 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  57.21 
 
 		 235 aa  297  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  56.77 
 
 		 235 aa  295  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  56.33 
 
 		 235 aa  294  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  56.33 
 
 		 235 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  56.33 
 
 		 235 aa  291  7e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  55.9 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  56.33 
 
 		 235 aa  290  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  55.9 
 
 		 235 aa  288  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  55.46 
 
 		 235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  55.46 
 
 		 235 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.44 
 
 		 232 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  55.41 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  55.41 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  55.41 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  55.41 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  54.98 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  54.98 
 
 		 235 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  54.98 
 
 		 235 aa  268  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  54.55 
 
 		 235 aa  268  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  54.55 
 
 		 252 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  55.41 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 		 235 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  48.05 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 235 aa  223  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 		 223 aa  198  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  40.27 
 
 		 224 aa  194  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  42.79 
 
 		 221 aa  194  9e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  41.89 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 225 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  39.82 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 223 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 226 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  40.44 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.5 
 
 		 235 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4448  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0887  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  0.0397846 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2853  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.17 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1271  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.624894  normal  0.128476 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00347  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with PhoR (or CreC)  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3210  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0427  transcriptional regulator PhoB  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0475  transcriptional regulator PhoB  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0429  transcriptional regulator PhoB  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.283039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0318  transcriptional regulator PhoB  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0467  transcriptional regulator PhoB  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3234  transcriptional regulator PhoB  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.456974  unclonable  0.00000000819474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0824  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4207  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.53 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1194  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.159741  normal  0.484581 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2015  two component transcriptional regulator  39.3 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1276  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1182  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1305  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.920206  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00351  hypothetical protein  35.09 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0579  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.86 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1296  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.86 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0785  DNA-binding response regulator PhoB  38.86 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1623  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.86 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2768  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.86 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.368066  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  37.61 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1490  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.86 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1520  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.86 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0572  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  38.86 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  35.68 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1277  two component transcriptional regulator  34.93 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0649233  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.96 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  38.96 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  34.21 
 
 		 229 aa  144  8.000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>