More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0655 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0655  response regulator  100 
 
 		 232 aa  479  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.29 
 
 		 246 aa  250  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  52.44 
 
 		 226 aa  249  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  48.18 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.77 
 
 		 226 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  49.55 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  47.96 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  47.96 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  46.15 
 
 		 221 aa  224  9e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  43.75 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 224 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 224 aa  208  5e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.18 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 235 aa  201  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  44.05 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  44 
 
 		 235 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  43.56 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  43.56 
 
 		 235 aa  201  7e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  44 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  43.24 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 		 222 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  39.38 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 235 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  39.82 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  40.27 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  39.38 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.75 
 
 		 222 aa  158  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.5 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  34.98 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  33.03 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  33.05 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  31.76 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 235 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  30.13 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.59 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  32.16 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  32.16 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  32.16 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  32.16 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  32.16 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  32.16 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  32.16 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  31.6 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  32.16 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  31.6 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0360  two component signal transduction response regulator  34.55 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.88 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  30.57 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  31.72 
 
 		 235 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  32.33 
 
 		 235 aa  138  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.41 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1434  DNA-binding response regulator PhoB  29.02 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  34.21 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1151  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.02 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.31 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  32.31 
 
 		 225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.7 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  32.13 
 
 		 227 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>