More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0172 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  100 
 
 		 237 aa  488  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 234 aa  270  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  53.68 
 
 		 234 aa  267  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  50.64 
 
 		 235 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  50.21 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  49.79 
 
 		 235 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  49.79 
 
 		 235 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  51.5 
 
 		 235 aa  259  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  50.64 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  51.5 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  49.79 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  49.79 
 
 		 235 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  49.79 
 
 		 235 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  47.62 
 
 		 231 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  48.05 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  48.05 
 
 		 231 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  47.62 
 
 		 231 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 235 aa  208  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  40.95 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  40.95 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  40.52 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  40.52 
 
 		 235 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  40.52 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 235 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  40.95 
 
 		 252 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 235 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 224 aa  161  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  32.27 
 
 		 223 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  34.23 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  33.63 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  34.98 
 
 		 232 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.98 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  30.49 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.91 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  34.08 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.92 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.35 
 
 		 223 aa  132  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  29.6 
 
 		 226 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  29.6 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.22 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  32.51 
 
 		 269 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.96 
 
 		 242 aa  122  7e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.28 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  33.17 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  31.97 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  30.94 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1562  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  28.21 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.279171  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0313  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 246 aa  118  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.12 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2146  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.14 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.74 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  29.2 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  27.75 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.84 
 
 		 224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3019  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  27.78 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0767733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01984  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with BaeS  27.78 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1577  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.78 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2112  two component transcriptional regulator  26.69 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01976  hypothetical protein  27.78 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0981  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  27.78 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.443633  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2221  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  27.78 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.97 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  28.07 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2371  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  27.78 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1154  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  27.78 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233901  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2872  two component transcriptional regulator  30.13 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702853  hitchhiker  0.00802276 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  30.4 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  28.95 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2361  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  28.21 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  30.33 
 
 		 248 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2477  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  28.21 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2261  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  28.21 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.806239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2368  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  28.21 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.531777  normal  0.413146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2317  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  28.21 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.539006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 231 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  29.55 
 
 		 271 aa  114  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  27.63 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  30.33 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>