More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2304 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  68.97 
 
 		 234 aa  348  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  65.65 
 
 		 235 aa  331  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  65.22 
 
 		 235 aa  329  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  64.78 
 
 		 235 aa  328  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  64.94 
 
 		 235 aa  328  5.0000000000000004e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  64.35 
 
 		 235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  64.5 
 
 		 235 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  64.35 
 
 		 235 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  64.35 
 
 		 235 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  64.35 
 
 		 235 aa  325  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  64.78 
 
 		 235 aa  324  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  60.26 
 
 		 231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  60.26 
 
 		 231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  60.26 
 
 		 231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  60.26 
 
 		 231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  60.26 
 
 		 231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  60.26 
 
 		 231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  59.31 
 
 		 231 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  59.83 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  59.74 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  59.83 
 
 		 231 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  58.87 
 
 		 231 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 		 232 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  53.68 
 
 		 237 aa  267  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  54.04 
 
 		 235 aa  266  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  54.04 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  54.04 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  54.04 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  54.04 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  53.62 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  53.62 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  53.71 
 
 		 235 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  54.04 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  54.04 
 
 		 235 aa  261  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  52.77 
 
 		 235 aa  259  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 235 aa  235  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  42.15 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 223 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  42.67 
 
 		 226 aa  191  9e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  40.81 
 
 		 224 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 223 aa  181  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  39.46 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  36.49 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.37 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  37.39 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  40.36 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  39.46 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  38.5 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  38.74 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.53 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  36.75 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  35.68 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  34.78 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  36.65 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.49 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 228 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.14 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  38.29 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  35.93 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  34.21 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  35.62 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 228 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.62 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  33.77 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0227  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  36 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  34.22 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0893  two component transcriptional regulator  32.62 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0216  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.305183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02230  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  33.63 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  35.11 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2112  two component transcriptional regulator  31.56 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  36.4 
 
 		 232 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  35.19 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0257  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0117449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1439  two component transcriptional regulator  31.33 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1457  two component transcriptional regulator  31.33 
 
 		 265 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  36 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  36.4 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>