More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03380 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  100 
 
 		 271 aa  559  1e-158  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.55 
 
 		 223 aa  278  5e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  50.67 
 
 		 226 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  49.78 
 
 		 226 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  50.69 
 
 		 222 aa  219  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 222 aa  208  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  40.37 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  38.91 
 
 		 226 aa  182  6e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.22 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  37.79 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  38.99 
 
 		 221 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  38.99 
 
 		 221 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.95 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.61 
 
 		 232 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  39.01 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  39.01 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 226 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  37.34 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  38.57 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  38.57 
 
 		 235 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  36.87 
 
 		 221 aa  158  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.36 
 
 		 228 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  38.12 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  37.12 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  37.78 
 
 		 226 aa  155  8e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  37.5 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  37.05 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  34.08 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  34.96 
 
 		 234 aa  149  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 		 235 aa  149  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  34.51 
 
 		 235 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  34.21 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 231 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  32.88 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.84 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  35 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  34.06 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  34.06 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  34.06 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  34.06 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  34.06 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  34.06 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  34.06 
 
 		 231 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  34.06 
 
 		 231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.16 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 234 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 231 aa  145  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1752  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.27 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  33.8 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  34.4 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.8 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  34.82 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  33.62 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3557  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  35.11 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.67 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 227 aa  142  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  32.14 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 231 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  33.79 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  36.49 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  33.79 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2112  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  30.8 
 
 		 228 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2940  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 228 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0012757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2216  two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.51 
 
 		 226 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  36.84 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.04 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  32.02 
 
 		 233 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  32.75 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3929  two component transcriptional regulator  33.77 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  35.53 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 236 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1307  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  34.96 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 228 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.6 
 
 		 229 aa  136  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2941  multi-component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 652 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 232 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>