More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0312 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  90.62 
 
 		 224 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  90.62 
 
 		 224 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.38 
 
 		 228 aa  288  6e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  46.61 
 
 		 223 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  215  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  42.86 
 
 		 232 aa  208  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  41.63 
 
 		 231 aa  199  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  40.72 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  40.72 
 
 		 231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 235 aa  194  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  40.45 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  43.89 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  43.44 
 
 		 235 aa  192  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  43.89 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  41.36 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 234 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  41.28 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  39.82 
 
 		 226 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.91 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  38.91 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  37.33 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.67 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.2 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 223 aa  155  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.91 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  33.63 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03380  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  34.4 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3302  two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288231  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1332  transcriptional regulatory protein BvrR  31.44 
 
 		 240 aa  141  6e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1681  two-component transcriptional regulator  31.74 
 
 		 233 aa  141  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0314  two component transcriptional regulator  31.74 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.765921 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  32.59 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  34.07 
 
 		 237 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0212  two component transcriptional regulator  30.87 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  33.63 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  33.63 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.11 
 
 		 228 aa  135  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.39 
 
 		 223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0402  two component transcriptional regulator  31.74 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.344138  normal  0.0526207 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 238 aa  134  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.88 
 
 		 230 aa  134  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  30.57 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.3 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03590  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  35.75 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0594239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2441  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  31.03 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  33.94 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0536  two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.68 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0111  two component transcriptional regulator  30.6 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.953605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  31.42 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>