More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1787 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1787  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0976  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 222 aa  178  5.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1528  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  177  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0343  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1910  DNA-binding response regulator  41.96 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0521  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5200  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2206  DNA-binding response regulator  40.91 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0495  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1093  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.11 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1310  DNA-binding response regulator  36.94 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0655  response regulator  39.73 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.134395  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0836  DNA-binding response regulator  35.62 
 
 		 222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.509227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4677  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 231 aa  164  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4948  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4725  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4567  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000110456  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4961  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5087  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4976  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0117  DNA-binding response regulator  34.39 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.527355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0272  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4989  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0115  DNA-binding response regulator  34.39 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0388834  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4587  DNA-binding response regulator  38.67 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.93847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3154  two component transcriptional regulator  36.28 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2177  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3483  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2419  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2597  DNA-binding response regulator  38.22 
 
 		 235 aa  158  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2343  response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0508948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4531  DNA-binding response regulator  34.51 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4337  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4173  response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.407882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4184  response regulator  34.51 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2704  response regulator receiver  39.73 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4519  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4671  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.292793  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2648  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0677  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00651698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4557  DNA-binding response regulator  34.96 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2614  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000167367 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2322  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 234 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2617  DNA-binding response regulator  37.78 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00078911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4572  DNA-binding response regulator  34.07 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.947729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4285  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2540  two component transcriptional regulator  38.22 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0258785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3334  two component transcriptional regulator  33.18 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2655  DNA-binding response regulator  37.33 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0834  DNA-binding response regulator  34.55 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000464203  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0312  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2378  response regulator  37.33 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0847711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2754  DNA-binding response regulator  37.33 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000477477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2570  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0682  two component transcriptional regulator  32.42 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.243903  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0697  response regulator receiver  32.42 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.156095  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2304  two component transcriptional regulator  34.67 
 
 		 234 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00553057  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0172  response regulator  33.33 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1415  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.27 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.279939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.63 
 
 		 223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3838  response regulator receiver domain-containing protein  32.58 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000539223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2112  two component transcriptional regulator  29.78 
 
 		 233 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.12 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  31.98 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0098  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.761303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.94 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2401  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  32.89 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1534  phosphate regulon two-component response regulator transcription regulator protein  33.19 
 
 		 237 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0097  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.2 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0537  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340982  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1713  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  33.19 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0484795  normal  0.810471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2021  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.19 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2162  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  33.33 
 
 		 235 aa  125  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0473  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  33.68 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  32.13 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  30.67 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4856  two component transcriptional regulator  32.9 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0324014 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1716  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  33.68 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00444869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2180  two component transcriptional regulator  32.61 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0753297 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.67 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  30.67 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.73 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3668  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.92 
 
 		 635 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4021  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.72 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5477  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  31.67 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1514  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.67 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0313038  normal  0.23375 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  31.67 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  32.74 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2915  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  29.73 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.02 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  32.14 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1445  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5511  two component transcriptional regulator  33.91 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.567595 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01026  response regulator  29.28 
 
 		 229 aa  121  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1416  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>