More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2133 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2133  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  429  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.809783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4351  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.92 
 
 		 229 aa  261  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.997672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4110  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.55 
 
 		 225 aa  238  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0038  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.46 
 
 		 223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.36 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.24 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.61 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.18 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  43.84 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  41.44 
 
 		 263 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 224 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  40.45 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2126  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.7 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.245988  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0644  two component transcriptional regulator  37.38 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.553024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.81 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0293  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591061  normal  0.658536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  43.64 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  145  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  41.01 
 
 		 224 aa  145  7.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.28 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2347  winged helix family two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000302018 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  42.52 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3349  two component transcriptional regulator  39.25 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.29 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.01 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.73 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3067  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.43316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  44.19 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0603  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3454  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 257 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.215717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  41.59 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3381  DNA-binding response regulator  37.9 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.060909  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  40.74 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2674  two component transcriptional regulator  40.18 
 
 		 230 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.238816  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0894  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1947  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421076  normal  0.0119241 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  37.44 
 
 		 222 aa  141  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.55 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1997  winged helix family two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.981118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3212  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  38.36 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.326214 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 228 aa  141  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1294  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.08 
 
 		 218 aa  141  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0476117  hitchhiker  0.00354598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3004  two component transcriptional regulator  37.85 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4039  winged helix family two component transcriptional regulator  37.85 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4978  winged helix family two component transcriptional regulator  37.85 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140502  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.98 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2453  winged helix family two component transcriptional regulator  39.47 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.147888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1026  two component transcriptional regulator  37.56 
 
 		 224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  40.83 
 
 		 225 aa  139  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1433  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3901  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.92 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0917  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  43.72 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1066  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  42.66 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0224  two component transcriptional regulator  39.64 
 
 		 226 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175792  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  37.5 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2318  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.642935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  42.99 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  43.17 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1787  two component transcriptional regulator  37.38 
 
 		 222 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132601  normal  0.0795693 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 231 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  40 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4988  two component transcriptional regulator  38.32 
 
 		 225 aa  138  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000131605 
 
 
-
 
NC_004310  BR0604  DNA-binding response regulator  39.55 
 
 		 229 aa  138  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.121209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1913  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  38.89 
 
 		 221 aa  138  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>