More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0038 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0038  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 223 aa  424  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2133  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.46 
 
 		 223 aa  216  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.809783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4351  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.6 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.997672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4110  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.2 
 
 		 225 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.91 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4549  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.703481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  47.89 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  47.89 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  42.01 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0801  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0203691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.48 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.38 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.48 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 231 aa  161  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  41.86 
 
 		 225 aa  161  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0950  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.61 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3444  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112849  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  45.07 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1783  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  46.48 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  43.26 
 
 		 218 aa  158  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  44.13 
 
 		 220 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.2 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  48.86 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 283 aa  158  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3908  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.487109 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  41.55 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1358  two component response regulator  41.86 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  44.24 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4647  DNA-binding response regulator  41.7 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4085  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.320847 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3817  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000444115  decreased coverage  0.00121668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.91 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3033  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.23 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.190199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  41.36 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 224 aa  155  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  47.35 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  46.01 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0630  two component transcriptional regulator  40.93 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2177  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00323539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0799  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  40.64 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  44.6 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  45.54 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.64 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3820  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  45.54 
 
 		 221 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4025  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3380  two component transcriptional regulator  41.26 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000549651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3626  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  45 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.18 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2487  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3852  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15775  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.15 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.07 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0003  response regulator receiver  45.79 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2897  DNA-binding response regulator TctD  44.91 
 
 		 224 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0994  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.337893  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2927  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3084  transcriptional regulator TctD  44.91 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2928  transcriptional regulatory protein TctD  44.91 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.501058  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2981  transcriptional regulator TctD  44.91 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.510212 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2964  transcriptional regulator TctD  44.91 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000947102 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1544  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 237 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  45.66 
 
 		 253 aa  151  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0428  transcriptional regulator FeuP  40.93 
 
 		 221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.461578  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.04 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  41.67 
 
 		 219 aa  151  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 224 aa  151  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  46.95 
 
 		 220 aa  151  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.1 
 
 		 224 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1599  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 228 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0936  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.966492  normal  0.099028 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  42.79 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  45.07 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  46.95 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  46.95 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 228 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1629  multi-component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 613 aa  150  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.703021  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  46.95 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  46.95 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1291  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.43 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.89 
 
 		 222 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  46.95 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1264  response regulator receiver  41.36 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227049  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1476  two component transcriptional regulator  39.81 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>