More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2096 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2119  response regulator  66.32 
 
 		 565 aa  790    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 567 aa  660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  56.67 
 
 		 567 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  100 
 
 		 577 aa  1196    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  97.4 
 
 		 577 aa  1164    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  97.05 
 
 		 577 aa  1159    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  56.17 
 
 		 565 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  71.69 
 
 		 369 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2108  response regulator receiver protein  74 
 
 		 224 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  29.81 
 
 		 550 aa  270  4e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  27.29 
 
 		 577 aa  212  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  25.65 
 
 		 575 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  26.93 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  24.49 
 
 		 574 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  26.58 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  26.59 
 
 		 562 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  26.21 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  26.54 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  27.04 
 
 		 568 aa  184  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  26.16 
 
 		 567 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  27.32 
 
 		 568 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  26.51 
 
 		 571 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  25.87 
 
 		 568 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  25.69 
 
 		 568 aa  174  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  26.26 
 
 		 563 aa  172  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  26.16 
 
 		 571 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  25.91 
 
 		 575 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  25.04 
 
 		 567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  26.04 
 
 		 572 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  24.96 
 
 		 561 aa  143  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  25.31 
 
 		 393 aa  127  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  23.74 
 
 		 365 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  30.07 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  22.73 
 
 		 383 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  24.19 
 
 		 373 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  22.44 
 
 		 378 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  23.92 
 
 		 390 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  26.18 
 
 		 504 aa  93.6  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  25.75 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  23.22 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  25 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  23.22 
 
 		 380 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  23.22 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.98 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3023  response regulator receiver protein  26.37 
 
 		 367 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.566048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  21.52 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3962  two-component response regulator PfeR  28.86 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  22.95 
 
 		 358 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4581  two-component response regulator  30 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.382311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  22.95 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0819  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.82 
 
 		 246 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  22.68 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.22 
 
 		 380 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  25.14 
 
 		 238 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  30.28 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  22.22 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  22.22 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.31 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.31 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  26.94 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  22.68 
 
 		 380 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.57 
 
 		 392 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 410 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52250  two-component response regulator  30.47 
 
 		 239 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.220903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1731  two component transcriptional regulator  25.83 
 
 		 236 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.135854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1112  DNA-binding transcriptional regulator TorR  27.75 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1051  DNA-binding transcriptional regulator TorR  27.75 
 
 		 236 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.44318 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3751  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  25.31 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1047  DNA-binding transcriptional regulator TorR  27.75 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.499715  normal  0.229032 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.37 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.62 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  24.19 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1554  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  30.86 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  28.67 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 544 aa  67  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2280  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.2 
 
 		 453 aa  67  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.45 
 
 		 242 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1016  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.16 
 
 		 243 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3411  two component transcriptional regulator  30.65 
 
 		 229 aa  66.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  25.61 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4503  winged helix family two component transcriptional regulator  23.74 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  28.46 
 
 		 236 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.19 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.36 
 
 		 229 aa  65.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.03 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.03 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.02 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  27.66 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1408  two component transcriptional regulator  23.74 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0248977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.03 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  24.54 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1228  DNA-binding transcriptional regulator TorR  28.8 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0790  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 566 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.391268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  29.03 
 
 		 236 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1990  DNA-binding transcriptional regulator TorR  27.13 
 
 		 241 aa  65.1  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.697946  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3376  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.418945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>