78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2110 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2110  stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 369 aa  769    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2096  response regulator receiver protein  71.69 
 
 		 577 aa  558  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.856197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2366  response regulator receiver protein  71.43 
 
 		 577 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2249  response regulator receiver protein  70.9 
 
 		 577 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.299733  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2119  response regulator  63.14 
 
 		 565 aa  481  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2220  response regulator receiver protein  55.41 
 
 		 565 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2095  response regulator receiver protein  55.38 
 
 		 567 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1879  response regulator receiver protein  55.11 
 
 		 567 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.686257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3297  response regulator receiver protein  33.15 
 
 		 550 aa  195  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1594  response regulator receiver protein  30.03 
 
 		 548 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0157  response regulator  29.32 
 
 		 568 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20780  putative two-component response regulator  30.16 
 
 		 571 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2157  response regulator receiver protein  30.21 
 
 		 577 aa  143  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1542  response regulator receiver domain-containing protein  31.23 
 
 		 567 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3365  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3688  response regulator receiver protein  31.69 
 
 		 564 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3924  response regulator receiver protein  29.63 
 
 		 563 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3580  response regulator receiver protein  27.49 
 
 		 564 aa  139  7.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2179  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.42 
 
 		 575 aa  139  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1784  putative two-component response regulator  30.16 
 
 		 571 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4363  response regulator receiver protein  29.74 
 
 		 563 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.470941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1504  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 563 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709749  normal  0.106415 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2819  response regulator receiver protein  29.49 
 
 		 562 aa  133  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0360472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34360  Response regulator  28.93 
 
 		 575 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.328347  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1964  response regulator  28.42 
 
 		 568 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.58831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1991  response regulator receiver protein  27.23 
 
 		 574 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3451  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:stage II sporulation E  28.88 
 
 		 568 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3118  response regulator receiver domain-containing protein  26.42 
 
 		 563 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01717  putative response regulator  27.12 
 
 		 568 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3440  response regulator receiver protein  27.84 
 
 		 572 aa  117  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1039  response regulator receiver domain-containing protein  24.21 
 
 		 567 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2342  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00850448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  29.65 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  30.32 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3534  response regulator receiver protein  26.18 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0106  stage II sporulation E  29.5 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2956  response regulator receiver protein  26.67 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3071  response regulator receiver protein  27.92 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442652 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2528  response regulator receiver protein  26.63 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.249668  normal  0.0734484 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  26.5 
 
 		 706 aa  59.7  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  25.24 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  25.38 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3700  serine phosphatase  21.72 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  22.97 
 
 		 612 aa  53.1  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  21.23 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  23.62 
 
 		 423 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  23.27 
 
 		 445 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  24.62 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.47 
 
 		 378 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  23.27 
 
 		 445 aa  49.7  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  24.51 
 
 		 560 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  21.94 
 
 		 502 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  20.6 
 
 		 754 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  27.1 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  21.5 
 
 		 566 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.06 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2226  response regulator receiver protein  28.06 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.916787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  20.11 
 
 		 341 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  28 
 
 		 683 aa  46.6  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  23.47 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  20.81 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1558  response regulator receiver protein  24.86 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.02 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0435  response regulator receiver protein  28.05 
 
 		 373 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2151  hypothetical protein  27.12 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  20.1 
 
 		 496 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2796  protein phosphatase 2C-like  27.09 
 
 		 397 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.44 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.45 
 
 		 997 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  25.5 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  26.49 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  23.92 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  22.54 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  24.12 
 
 		 687 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.31 
 
 		 371 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  21.83 
 
 		 957 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  25.77 
 
 		 453 aa  42.7  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.61 
 
 		 572 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  23.98 
 
 		 708 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>