More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1833 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 560 aa  1145    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  64.85 
 
 		 543 aa  752    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1021  putative PAS/PAC sensor protein  54.86 
 
 		 564 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1360  putative PAS/PAC sensor protein  46.48 
 
 		 536 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1789  response regulator receiver protein  62.7 
 
 		 142 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  33.11 
 
 		 642 aa  151  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  27.75 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  25.09 
 
 		 557 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.57 
 
 		 684 aa  140  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 642 aa  137  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  24.66 
 
 		 557 aa  135  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  25.95 
 
 		 637 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.57 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  25.37 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.68 
 
 		 1355 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  25.43 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  29.67 
 
 		 1100 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 1465 aa  120  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2368  putative PAS/PAC sensor protein  34.7 
 
 		 270 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  27 
 
 		 649 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  34.33 
 
 		 965 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  32.3 
 
 		 631 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2723  putative PAS/PAC sensor protein  34.47 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.82 
 
 		 708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  37.42 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  27.95 
 
 		 366 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  25.26 
 
 		 536 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1568  response regulator receiver protein  40.15 
 
 		 262 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0970  response regulator receiver  39.04 
 
 		 438 aa  114  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0347  PAS  23.78 
 
 		 513 aa  113  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000072068 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3472  response regulator receiver domain-containing protein  37.06 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  28.67 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 		 520 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4550  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.01769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  28.35 
 
 		 706 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2745  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.862781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2942  response regulator  38.06 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.714666  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.33 
 
 		 452 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.8 
 
 		 994 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.1 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  29.39 
 
 		 475 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  38.03 
 
 		 806 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  29.05 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  22.43 
 
 		 754 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  29.05 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.8 
 
 		 687 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  41.41 
 
 		 823 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  29.05 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  29.05 
 
 		 475 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  28.77 
 
 		 1083 aa  105  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  29.05 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1534  response regulator receiver protein  36.99 
 
 		 439 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  29.05 
 
 		 518 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  37.41 
 
 		 476 aa  104  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1726  putative PAS/PAC sensor protein  23.53 
 
 		 504 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0909206  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  24.03 
 
 		 775 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  28.73 
 
 		 445 aa  103  7e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  33.55 
 
 		 479 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  27.17 
 
 		 885 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.41 
 
 		 515 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2716  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.5 
 
 		 629 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  26.91 
 
 		 377 aa  102  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  39.07 
 
 		 317 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2363  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 189 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  42.52 
 
 		 312 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03496  response regulator  35.62 
 
 		 434 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3257  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.37 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  26.12 
 
 		 516 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  36.23 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  36.23 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  36.23 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 		 1156 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  36.23 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  36.23 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  36.23 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.52 
 
 		 678 aa  100  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2541  response regulator  31.36 
 
 		 441 aa  100  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  37.75 
 
 		 315 aa  100  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  24.4 
 
 		 637 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  25.66 
 
 		 853 aa  99.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  36.23 
 
 		 481 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.1 
 
 		 735 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.26 
 
 		 1180 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  34.78 
 
 		 484 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1912  cyclic nucleotide-binding protein  40.5 
 
 		 590 aa  99  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0713503  normal  0.243299 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1895  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 185 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.706146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  24.9 
 
 		 1079 aa  98.6  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  24.52 
 
 		 545 aa  98.2  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 516 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  35.66 
 
 		 746 aa  97.8  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.34 
 
 		 602 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  26.7 
 
 		 1017 aa  97.4  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.07 
 
 		 570 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06147  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  39.83 
 
 		 549 aa  97.1  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015374  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01019  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  39.83 
 
 		 549 aa  97.1  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.159296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  27.7 
 
 		 477 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  28.4 
 
 		 376 aa  96.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1538  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  40.78 
 
 		 563 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>