More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4817 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  60.14 
 
 
557 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  58.71 
 
 
557 aa  639    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  100 
 
 
553 aa  1135    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  47.81 
 
 
1156 aa  268  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  45.51 
 
 
1180 aa  267  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  44.1 
 
 
1172 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1423  response regulator receiver (CheY) and GAF domain-containing protein  45.73 
 
 
315 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4317  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  47.1 
 
 
317 aa  233  9e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.248315  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3971  putative GAF sensor protein  42.81 
 
 
312 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3395  response regulator receiver protein  55.91 
 
 
132 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.306635  normal  0.186564 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
1480 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.33 
 
 
497 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  34.63 
 
 
1082 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.26 
 
 
1332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2793  two-component response regulator  42.11 
 
 
154 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0292911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  23.44 
 
 
543 aa  127  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.5 
 
 
391 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0606  response regulator  44.29 
 
 
447 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  31.11 
 
 
459 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.15 
 
 
507 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.52 
 
 
572 aa  125  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  25.43 
 
 
560 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.28 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
391 aa  121  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0745  response regulator/HD domain-containing protein  50.39 
 
 
481 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0050  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.1 
 
 
515 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0532507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.95 
 
 
957 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0615  response regulator  47.33 
 
 
484 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.177724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.18 
 
 
389 aa  120  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1529  response regulator receiver  43.28 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0261  response regulator  49.61 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2469  response regulator  49.61 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0923  response regulator  49.61 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2388  response regulator  49.61 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0757  response regulator/HD domain-containing protein  49.61 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2689  response regulator  49.61 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  31.41 
 
 
521 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  32.6 
 
 
455 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0731  response regulator  45.52 
 
 
476 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  28.45 
 
 
379 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6441  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.11 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3962  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.22 
 
 
495 aa  118  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1360  putative PAS/PAC sensor protein  23.42 
 
 
536 aa  118  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1161  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.65 
 
 
496 aa  118  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.175427  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1315  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.03 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  29.32 
 
 
630 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.23 
 
 
480 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  30.99 
 
 
465 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  29.32 
 
 
366 aa  117  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2314  response regulator  45.26 
 
 
475 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1662  response regulator  45.26 
 
 
475 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0599  response regulator  45.26 
 
 
475 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  27.83 
 
 
470 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1923  response regulator  45.26 
 
 
475 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.537818  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1716  response regulator  45.26 
 
 
475 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0711  response regulator  45.26 
 
 
518 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226782  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.89 
 
 
961 aa  117  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  27.92 
 
 
469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  36.92 
 
 
1100 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5575  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5939  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45.45 
 
 
472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.01 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06147  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  45.53 
 
 
549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015374  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7223  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.01 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.58817  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2231  response regulator  44.53 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01019  Putative signal protein with GGDEF, EAL and two component receiver domains  45.53 
 
 
549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.159296  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6276  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  47.01 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 
516 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.17 
 
 
465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  25.88 
 
 
516 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.47 
 
 
1087 aa  114  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2012  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.12 
 
 
484 aa  114  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.39 
 
 
482 aa  114  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1912  cyclic nucleotide-binding protein  45 
 
 
590 aa  114  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0713503  normal  0.243299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  29.68 
 
 
413 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  32.31 
 
 
644 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0972  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.61 
 
 
994 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.172335  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  30.24 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  31.46 
 
 
1083 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.1 
 
 
1465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2273  putative two-component response regulator  44.07 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.438912  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2388  response regulator receiver protein  40.46 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.319662 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  32.71 
 
 
716 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3476  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.09 
 
 
479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1569  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  44.63 
 
 
452 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.59 
 
 
563 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  29.69 
 
 
1087 aa  111  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1980  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.41 
 
 
449 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247955  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1404  response regulator receiver protein  39.57 
 
 
154 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  33.65 
 
 
1079 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26830  putative two-component response regulator  43.22 
 
 
303 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  29.55 
 
 
460 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  28.87 
 
 
631 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  31.52 
 
 
723 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  29.79 
 
 
445 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30 
 
 
486 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1982  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  43.28 
 
 
1355 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  33.96 
 
 
642 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1525  ATP-binding region ATPase domain protein  41.32 
 
 
359 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.636632 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  34.95 
 
 
687 aa  109  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>