More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0288 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 		 572 aa  1125    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  33.06 
 
 		 612 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  42.6 
 
 		 455 aa  206  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  42.91 
 
 		 381 aa  193  9e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  41.01 
 
 		 366 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  39.43 
 
 		 687 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.02 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.59 
 
 		 388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.93 
 
 		 507 aa  180  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  35.63 
 
 		 706 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  28.83 
 
 		 404 aa  174  5e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  38.78 
 
 		 631 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  38.06 
 
 		 708 aa  173  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  39.36 
 
 		 637 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  29.61 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.75 
 
 		 1004 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  30.63 
 
 		 464 aa  171  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  39.44 
 
 		 410 aa  170  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  37.85 
 
 		 637 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  38.8 
 
 		 1100 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.09 
 
 		 748 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  35.87 
 
 		 460 aa  166  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  36.65 
 
 		 465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.63 
 
 		 467 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  36.07 
 
 		 477 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.29 
 
 		 1332 aa  163  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  36.23 
 
 		 469 aa  163  1e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  34.98 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.45 
 
 		 1017 aa  163  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  30.57 
 
 		 423 aa  162  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  40.08 
 
 		 649 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.94 
 
 		 465 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  31.53 
 
 		 445 aa  161  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  36.8 
 
 		 1079 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.25 
 
 		 482 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  35.51 
 
 		 463 aa  160  9e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  35.74 
 
 		 1087 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  39.46 
 
 		 563 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  37.86 
 
 		 684 aa  156  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  34.49 
 
 		 443 aa  156  9e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  37 
 
 		 470 aa  156  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.45 
 
 		 995 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  35.86 
 
 		 754 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.97 
 
 		 486 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  37.3 
 
 		 557 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  34.06 
 
 		 462 aa  154  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  34.66 
 
 		 1087 aa  153  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.04 
 
 		 1480 aa  153  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.97 
 
 		 497 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.73 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  31.72 
 
 		 474 aa  152  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  35.43 
 
 		 1083 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  39.67 
 
 		 997 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  32.12 
 
 		 566 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.02 
 
 		 447 aa  150  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.58 
 
 		 792 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  30.74 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.29 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  39.18 
 
 		 657 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  36.02 
 
 		 379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  34.2 
 
 		 650 aa  148  3e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.64 
 
 		 678 aa  148  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  38.78 
 
 		 643 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  34.77 
 
 		 716 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  34.44 
 
 		 557 aa  144  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  37.92 
 
 		 642 aa  144  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  35.21 
 
 		 543 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  32.53 
 
 		 705 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  32.81 
 
 		 536 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.43 
 
 		 590 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  35.06 
 
 		 644 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  36.76 
 
 		 649 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  34.15 
 
 		 630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.54 
 
 		 385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  35.04 
 
 		 570 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  35.77 
 
 		 521 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.96 
 
 		 957 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  35.07 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  34.1 
 
 		 413 aa  140  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.6 
 
 		 480 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  33.73 
 
 		 1082 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  32.92 
 
 		 472 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.59 
 
 		 389 aa  136  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.44 
 
 		 961 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  33.33 
 
 		 429 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  34.43 
 
 		 438 aa  136  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1680  sigma factor B regulator protein  31.56 
 
 		 333 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  35.18 
 
 		 642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  34.5 
 
 		 648 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  33.21 
 
 		 634 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 		 377 aa  135  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  35.51 
 
 		 885 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  33.21 
 
 		 467 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  38.66 
 
 		 516 aa  133  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  30.43 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.58 
 
 		 396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  33.21 
 
 		 710 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  33.74 
 
 		 723 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.09 
 
 		 606 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>