More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1680 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1680  sigma factor B regulator protein  100 
 
 		 333 aa  682    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2141  stage II sporulation E family protein  84.38 
 
 		 333 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2104  stage II sporulation E family protein  84.38 
 
 		 333 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3489  putative PAS/PAC sensor protein  35.39 
 
 		 636 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.56 
 
 		 572 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.02 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.92 
 
 		 637 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  29.05 
 
 		 631 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.86 
 
 		 563 aa  125  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  28.42 
 
 		 687 aa  125  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  28.75 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  26.8 
 
 		 455 aa  123  6e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.69 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.2 
 
 		 995 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.61 
 
 		 997 aa  119  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  28.81 
 
 		 410 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  26.15 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  24.9 
 
 		 462 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  27.17 
 
 		 885 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  26.95 
 
 		 460 aa  112  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.21 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.43 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  29.74 
 
 		 637 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  24.21 
 
 		 465 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  28.33 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.22 
 
 		 642 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  30.31 
 
 		 379 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.91 
 
 		 486 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.18 
 
 		 1004 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  28.57 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  26.94 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.73 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  25.5 
 
 		 470 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  23.94 
 
 		 1083 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  24.9 
 
 		 463 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.47 
 
 		 1079 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.4 
 
 		 384 aa  106  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  25.21 
 
 		 536 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  26.35 
 
 		 474 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  26.47 
 
 		 642 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  24.7 
 
 		 469 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  26.36 
 
 		 649 aa  104  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  25.95 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  25.95 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.19 
 
 		 507 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  24.07 
 
 		 1087 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  26.47 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  26.78 
 
 		 1100 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  27.69 
 
 		 660 aa  102  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  28.45 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  24.37 
 
 		 775 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  25.76 
 
 		 708 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  28.97 
 
 		 464 aa  100  3e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  27.38 
 
 		 563 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  23.95 
 
 		 1087 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.9 
 
 		 447 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  27.5 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.4 
 
 		 1332 aa  98.6  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.2 
 
 		 497 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.89 
 
 		 1017 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  25.56 
 
 		 459 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  25.2 
 
 		 684 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  24.62 
 
 		 570 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  25.69 
 
 		 467 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.9 
 
 		 447 aa  95.9  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  24.91 
 
 		 472 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  25.63 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  28.22 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  27.57 
 
 		 723 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  26.49 
 
 		 502 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.29 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  24.59 
 
 		 846 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  26.83 
 
 		 1082 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.7 
 
 		 423 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  25.44 
 
 		 521 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  26.29 
 
 		 447 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.95 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  25.4 
 
 		 391 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.31 
 
 		 590 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  22.44 
 
 		 706 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  25.1 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  24.59 
 
 		 754 aa  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  24.69 
 
 		 716 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  23.97 
 
 		 612 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  26.42 
 
 		 566 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  22.35 
 
 		 1480 aa  89.7  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.99 
 
 		 606 aa  89.4  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  24.69 
 
 		 445 aa  89.4  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  26.3 
 
 		 557 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  28.46 
 
 		 649 aa  89  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.51 
 
 		 602 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  25.52 
 
 		 445 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2083  Stage II sporulation E family protein  26.55 
 
 		 556 aa  87.8  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.611306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  24.71 
 
 		 705 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  26.21 
 
 		 634 aa  87.4  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  25.47 
 
 		 557 aa  87  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.68 
 
 		 391 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  25.45 
 
 		 657 aa  86.3  6e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  26.97 
 
 		 648 aa  86.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  26.75 
 
 		 381 aa  85.9  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>