More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2083 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2083  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 556 aa  1125    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.611306  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  33.81 
 
 		 649 aa  159  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  32.16 
 
 		 1087 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  34.83 
 
 		 637 aa  143  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  32.03 
 
 		 1087 aa  144  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.92 
 
 		 572 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  31.75 
 
 		 1100 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  33.47 
 
 		 366 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  33.33 
 
 		 467 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  33.47 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  32.27 
 
 		 631 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  32.4 
 
 		 423 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  31.78 
 
 		 410 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  33.2 
 
 		 1082 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  34.03 
 
 		 708 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  31.35 
 
 		 455 aa  126  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.96 
 
 		 792 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  28.77 
 
 		 445 aa  125  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  29.37 
 
 		 1083 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.37 
 
 		 497 aa  123  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31 
 
 		 563 aa  123  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  30.82 
 
 		 684 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  30.97 
 
 		 642 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.74 
 
 		 997 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.1 
 
 		 637 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.42 
 
 		 590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.16 
 
 		 384 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  31.77 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  30.51 
 
 		 1079 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  31.37 
 
 		 642 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  28.08 
 
 		 445 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  31.23 
 
 		 853 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  29.3 
 
 		 754 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  27.71 
 
 		 451 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  31.25 
 
 		 706 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  31.1 
 
 		 885 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.56 
 
 		 1017 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 		 477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  27.93 
 
 		 536 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.8 
 
 		 995 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 		 667 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 		 670 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  29.84 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.15 
 
 		 1004 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 775 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 		 817 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.2 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  32.43 
 
 		 817 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  29.07 
 
 		 683 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  31.43 
 
 		 376 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  30.64 
 
 		 400 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  27.84 
 
 		 470 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  30.08 
 
 		 464 aa  110  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.52 
 
 		 1332 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  30.14 
 
 		 682 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  26.54 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0346  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 		 479 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  27.24 
 
 		 612 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.57 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.99 
 
 		 388 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  28.19 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.18 
 
 		 1480 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  31.22 
 
 		 687 aa  107  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  27.42 
 
 		 404 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  27.03 
 
 		 846 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  28.67 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  28.71 
 
 		 566 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  28.67 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.1 
 
 		 371 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.37 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.85 
 
 		 602 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  29.28 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2141  stage II sporulation E family protein  27.91 
 
 		 333 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2104  stage II sporulation E family protein  27.91 
 
 		 333 aa  104  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799939  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 967 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  32.52 
 
 		 967 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  31.25 
 
 		 463 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.49 
 
 		 467 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.01 
 
 		 396 aa  103  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1680  sigma factor B regulator protein  27.13 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.39 
 
 		 678 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.92 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  26.14 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  30.29 
 
 		 381 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  27.44 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  29.51 
 
 		 254 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  31.45 
 
 		 454 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.03 
 
 		 480 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  28.3 
 
 		 840 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1628  response regulator receiver protein  32.31 
 
 		 380 aa  101  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  29.39 
 
 		 465 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.17 
 
 		 486 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.29 
 
 		 961 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.29 
 
 		 957 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.98 
 
 		 465 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  32.76 
 
 		 249 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.22 
 
 		 393 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  30.91 
 
 		 557 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.22 
 
 		 393 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>