More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2345 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  54.37 
 
 
278 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  50.21 
 
 
262 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  48.95 
 
 
254 aa  235  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  30.99 
 
 
438 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  31.49 
 
 
443 aa  114  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 
846 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.67 
 
 
467 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.82 
 
 
612 aa  108  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  33.86 
 
 
470 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  29.83 
 
 
708 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  31.1 
 
 
447 aa  102  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.95 
 
 
385 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
649 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.21 
 
 
590 aa  99  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  31.89 
 
 
469 aa  97.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  27.92 
 
 
464 aa  98.2  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.92 
 
 
423 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  21.89 
 
 
362 aa  96.3  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.53 
 
 
447 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  27.31 
 
 
706 aa  96.3  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  28.92 
 
 
631 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.17 
 
 
455 aa  95.9  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.61 
 
 
563 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.1 
 
 
467 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  32.5 
 
 
637 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.87 
 
 
497 aa  94.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  30.98 
 
 
465 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.69 
 
 
423 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  27.57 
 
 
429 aa  94  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.96 
 
 
572 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.98 
 
 
465 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.67 
 
 
507 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  30.37 
 
 
563 aa  92.4  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.58 
 
 
388 aa  92.4  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  29.23 
 
 
502 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 
474 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 
474 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  30.15 
 
 
477 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.74 
 
 
447 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  30.53 
 
 
463 aa  89.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  27.12 
 
 
445 aa  89  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  30.56 
 
 
376 aa  89  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.16 
 
 
516 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.84 
 
 
997 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  27.12 
 
 
445 aa  88.6  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.61 
 
 
396 aa  87.8  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2083  Stage II sporulation E family protein  31.82 
 
 
556 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.611306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0541  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.96 
 
 
445 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.34 
 
 
957 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  28.03 
 
 
394 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  27.4 
 
 
451 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  26.75 
 
 
381 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  31.67 
 
 
377 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  32.69 
 
 
397 aa  86.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  30.16 
 
 
684 aa  86.7  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.95 
 
 
792 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  27.53 
 
 
533 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  28.45 
 
 
1087 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1628  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
380 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.27 
 
 
995 aa  86.3  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  28.75 
 
 
1100 aa  86.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.24 
 
 
384 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  26.75 
 
 
644 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.11 
 
 
480 aa  86.3  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30 
 
 
606 aa  86.3  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.53 
 
 
1480 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  28.57 
 
 
404 aa  85.9  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  30.65 
 
 
460 aa  85.9  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  28.45 
 
 
1087 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  25.95 
 
 
519 aa  85.5  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  26.42 
 
 
400 aa  85.5  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  27.64 
 
 
451 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  28.4 
 
 
683 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  29.85 
 
 
462 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  25.93 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.92 
 
 
1332 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  33.17 
 
 
637 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  29.79 
 
 
395 aa  84  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  28.89 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  32.99 
 
 
660 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  27.32 
 
 
697 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  25.93 
 
 
380 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.68 
 
 
482 aa  83.2  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.57 
 
 
716 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  28.99 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  27.08 
 
 
775 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30 
 
 
1083 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0916  putative PAS/PAC sensor protein  35.95 
 
 
781 aa  83.2  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.557683 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2893  putative PAS/PAC sensor protein  30.24 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  26.72 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2937  putative PAS/PAC sensor protein  30.24 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2923  putative PAS/PAC sensor protein  30.24 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  30 
 
 
474 aa  82.4  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  29.05 
 
 
366 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  30.36 
 
 
708 aa  82  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  24.39 
 
 
380 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  29.8 
 
 
705 aa  81.6  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  25.42 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.8 
 
 
642 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>