More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0731 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  100 
 
 		 396 aa  801    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  44.05 
 
 		 1087 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 		 637 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  44.05 
 
 		 1087 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  41.63 
 
 		 1079 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  43.8 
 
 		 649 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  42.86 
 
 		 853 aa  196  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  41.94 
 
 		 1100 aa  196  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  37.01 
 
 		 684 aa  193  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  40.7 
 
 		 410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  42.86 
 
 		 366 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  36.43 
 
 		 536 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  38.7 
 
 		 754 aa  186  9e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 775 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  38.17 
 
 		 1083 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  37.93 
 
 		 642 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  36.78 
 
 		 642 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  37.26 
 
 		 1082 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  35.88 
 
 		 637 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1654  response regulator, putative  49.01 
 
 		 349 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  33.86 
 
 		 706 aa  145  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1811  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.36 
 
 		 347 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00843757 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2407  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  46.36 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.21688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.38 
 
 		 391 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.49 
 
 		 602 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.87 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.68 
 
 		 389 aa  141  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 391 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.69 
 
 		 384 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1378  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  43.05 
 
 		 348 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00581699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1919  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  45.64 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.43 
 
 		 388 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  27.16 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  28.61 
 
 		 566 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_002936  DET0624  response regulator  40.82 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  27.46 
 
 		 941 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0597  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.82 
 
 		 334 aa  133  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.58 
 
 		 572 aa  132  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.33 
 
 		 385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2374  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.72 
 
 		 348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_565  response regulator receiver:metal-dependent phosphohydrolase, HD subdomain protein  40.14 
 
 		 334 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.4 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  31.78 
 
 		 631 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1406  response regulator  41.22 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.98 
 
 		 486 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.55 
 
 		 371 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  31.18 
 
 		 708 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  25.79 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.63 
 
 		 378 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  25.68 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  29.01 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.75 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  25.85 
 
 		 396 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  29.92 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  29.57 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  26.88 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  27.99 
 
 		 412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  29.18 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.95 
 
 		 563 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  29.25 
 
 		 377 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  31.89 
 
 		 563 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  27.49 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  28.52 
 
 		 474 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  26.88 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.74 
 
 		 1004 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.5 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.46 
 
 		 507 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.68 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  29.62 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.06 
 
 		 957 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.8 
 
 		 1017 aa  116  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  30.83 
 
 		 467 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  31.76 
 
 		 470 aa  116  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  34.82 
 
 		 846 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  29.04 
 
 		 463 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  28.5 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  28.2 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  29.46 
 
 		 678 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.62 
 
 		 687 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  26.9 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  30.98 
 
 		 469 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1991  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  39.46 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.94 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  23.4 
 
 		 560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  29.3 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  26.53 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0140  response regulator receiver protein  26.84 
 
 		 371 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.15 
 
 		 526 aa  113  5e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  31.68 
 
 		 502 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  26.02 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  32.31 
 
 		 455 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.33 
 
 		 411 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3484  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.03 
 
 		 395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1829  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2031  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2101  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.41 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  28.87 
 
 		 543 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>