More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3158 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 
443 aa  915    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.98 
 
 
563 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.39 
 
 
995 aa  166  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  33.72 
 
 
366 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  33.45 
 
 
706 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.49 
 
 
572 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  33.6 
 
 
708 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  35.11 
 
 
631 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  35.19 
 
 
467 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  34.71 
 
 
438 aa  152  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  33.71 
 
 
637 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.21 
 
 
486 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.91 
 
 
1017 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.72 
 
 
482 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  28.42 
 
 
1079 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.96 
 
 
1004 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.45 
 
 
480 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.45 
 
 
384 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 
649 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  33.94 
 
 
451 aa  144  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  30.4 
 
 
477 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  31.43 
 
 
429 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  35.74 
 
 
644 aa  140  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  33.74 
 
 
683 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  34.52 
 
 
648 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  35.8 
 
 
262 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  32.95 
 
 
397 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.7 
 
 
1332 aa  139  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.12 
 
 
606 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.25 
 
 
997 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.08 
 
 
957 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  33.47 
 
 
885 aa  138  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  32.17 
 
 
705 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  29.39 
 
 
447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  32.1 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.26 
 
 
748 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  35.39 
 
 
381 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  32.54 
 
 
716 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.03 
 
 
1083 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  33.61 
 
 
1100 aa  137  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  33.57 
 
 
570 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  30.57 
 
 
413 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  33.33 
 
 
472 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.43 
 
 
687 aa  136  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  33.88 
 
 
1087 aa  136  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  31.06 
 
 
612 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  33.47 
 
 
1087 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  29.21 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  29.21 
 
 
474 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  33.73 
 
 
705 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.91 
 
 
447 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  32.41 
 
 
846 aa  133  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.18 
 
 
507 aa  134  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.35 
 
 
447 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  32.94 
 
 
634 aa  133  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  24.75 
 
 
459 aa  133  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.18 
 
 
1082 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  32.47 
 
 
775 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.32 
 
 
423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  31.29 
 
 
521 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  30.97 
 
 
754 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  29.82 
 
 
723 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.33 
 
 
388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.66 
 
 
497 aa  130  6e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  31.65 
 
 
502 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.04 
 
 
590 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  34.91 
 
 
637 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  33.07 
 
 
649 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  29.87 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  33.07 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  29.37 
 
 
535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.51 
 
 
961 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  34.11 
 
 
563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.24 
 
 
467 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  32.07 
 
 
462 aa  126  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  30.5 
 
 
642 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  30.04 
 
 
684 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  30.89 
 
 
254 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0346  protein serine/threonine phosphatase  35.18 
 
 
479 aa  124  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  27.65 
 
 
566 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  28.97 
 
 
404 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.08 
 
 
642 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.63 
 
 
496 aa  123  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  34 
 
 
376 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.35 
 
 
396 aa  123  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  30.39 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.42 
 
 
792 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  27.9 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  28.88 
 
 
469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.92 
 
 
396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  32.53 
 
 
678 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.95 
 
 
1480 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 
379 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  27.08 
 
 
463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  27.48 
 
 
584 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.04 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  27.24 
 
 
660 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  29.1 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>