More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2473 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  100 
 
 
462 aa  942    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  57.58 
 
 
463 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  55.08 
 
 
477 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  54.49 
 
 
474 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  53.28 
 
 
474 aa  523  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  54.49 
 
 
474 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  56.24 
 
 
460 aa  517  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  55.22 
 
 
482 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  50.66 
 
 
470 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  49.89 
 
 
467 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  50.11 
 
 
469 aa  424  1e-117  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  47.84 
 
 
465 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.94 
 
 
465 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.5 
 
 
447 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.33 
 
 
423 aa  317  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.79 
 
 
447 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  36.92 
 
 
447 aa  302  7.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00101  hypothetical protein  47.17 
 
 
285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.843979  hitchhiker  0.000559398 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00111  hypothetical protein  52.75 
 
 
200 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.57 
 
 
563 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  32.08 
 
 
366 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  37.78 
 
 
708 aa  169  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  32.7 
 
 
1100 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  33.22 
 
 
1083 aa  160  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  37.13 
 
 
846 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  32.06 
 
 
1079 aa  158  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  31.38 
 
 
637 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.06 
 
 
572 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  36.76 
 
 
455 aa  154  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  34.57 
 
 
1087 aa  152  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  33.83 
 
 
1087 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  35.96 
 
 
706 aa  150  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  31.85 
 
 
1082 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 
642 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  28.35 
 
 
612 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  36.63 
 
 
687 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.51 
 
 
507 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  31.44 
 
 
410 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  30.41 
 
 
381 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.94 
 
 
642 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.82 
 
 
388 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  33.33 
 
 
853 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.93 
 
 
1017 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.93 
 
 
1004 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.82 
 
 
995 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  30.24 
 
 
438 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.01 
 
 
1332 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.73 
 
 
997 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  30.35 
 
 
536 aa  136  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.62 
 
 
631 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  30.45 
 
 
630 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  32.06 
 
 
637 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.93 
 
 
1480 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.84 
 
 
684 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  27.45 
 
 
754 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  30.04 
 
 
413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  31.91 
 
 
775 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.03 
 
 
480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.06 
 
 
961 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  32.52 
 
 
445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.04 
 
 
957 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  32.07 
 
 
443 aa  126  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  31.82 
 
 
445 aa  125  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  32.03 
 
 
376 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  31.97 
 
 
379 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  31.5 
 
 
570 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.1 
 
 
497 aa  124  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.3 
 
 
384 aa  123  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  31.08 
 
 
710 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  35.68 
 
 
516 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  28.71 
 
 
557 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.8 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  31.62 
 
 
648 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.42 
 
 
748 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.1 
 
 
389 aa  121  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  33.1 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  29.66 
 
 
885 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  30.23 
 
 
557 aa  120  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.15 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  30.63 
 
 
716 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  30.42 
 
 
361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  32.61 
 
 
649 aa  118  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  33.02 
 
 
516 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.82 
 
 
391 aa  116  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.53 
 
 
606 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  27.18 
 
 
584 aa  116  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  31.37 
 
 
786 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  27.99 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  30.41 
 
 
705 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1680  sigma factor B regulator protein  24.9 
 
 
333 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  29.12 
 
 
502 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  31 
 
 
785 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  30.63 
 
 
396 aa  113  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  29.18 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  30.48 
 
 
486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  30.8 
 
 
365 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2104  stage II sporulation E family protein  24.03 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.799939  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2141  stage II sporulation E family protein  24.03 
 
 
333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.44 
 
 
516 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>