More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1584 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 
649 aa  1315    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  43.44 
 
 
644 aa  512  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  38.57 
 
 
648 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  39.56 
 
 
645 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  38.96 
 
 
657 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  38.12 
 
 
643 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  35.81 
 
 
705 aa  293  8e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  36.28 
 
 
705 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  34.83 
 
 
716 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  40.42 
 
 
678 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  32.95 
 
 
708 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  49.6 
 
 
486 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  31.06 
 
 
643 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  30.57 
 
 
706 aa  224  3e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  42.81 
 
 
634 aa  220  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  43.66 
 
 
379 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  36.54 
 
 
543 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  38.69 
 
 
535 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  39.29 
 
 
660 aa  195  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  30.64 
 
 
687 aa  193  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  35.69 
 
 
631 aa  188  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  37.29 
 
 
723 aa  187  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  39.36 
 
 
683 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  39.1 
 
 
413 aa  173  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  42.31 
 
 
671 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  42.51 
 
 
455 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  41.5 
 
 
451 aa  166  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.17 
 
 
1004 aa  164  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  38.1 
 
 
566 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.63 
 
 
563 aa  162  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.69 
 
 
1017 aa  157  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  40.16 
 
 
366 aa  156  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  33.53 
 
 
451 aa  157  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.29 
 
 
995 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  35.36 
 
 
453 aa  150  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.37 
 
 
997 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  37.35 
 
 
708 aa  146  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.84 
 
 
957 aa  143  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  36.44 
 
 
472 aa  143  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.76 
 
 
572 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.22 
 
 
606 aa  141  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.48 
 
 
961 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  32.14 
 
 
521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.49 
 
 
792 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  34.1 
 
 
340 aa  136  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  36.02 
 
 
459 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  33.68 
 
 
649 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  31.04 
 
 
633 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.2 
 
 
385 aa  133  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  34.96 
 
 
381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  33.59 
 
 
1087 aa  132  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  34.52 
 
 
1100 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1335  serine phosphatase  29.75 
 
 
710 aa  131  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.96809  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  39.34 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  24.12 
 
 
705 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  38.93 
 
 
361 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  32.85 
 
 
474 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  32.85 
 
 
474 aa  130  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.8 
 
 
480 aa  130  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  36.96 
 
 
570 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.2 
 
 
1480 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  33.46 
 
 
1087 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  33.07 
 
 
443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0877  regulatory protein, putative  26.18 
 
 
650 aa  128  3e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.410467  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.48 
 
 
507 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.06 
 
 
1332 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  36.78 
 
 
470 aa  127  6e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  33.33 
 
 
612 aa  127  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  29.57 
 
 
521 aa  127  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  32.8 
 
 
1082 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0971  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 
630 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  36.09 
 
 
846 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0968  protein serine/threonine phosphatase  31.06 
 
 
630 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.570146  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 
376 aa  124  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  33.57 
 
 
469 aa  123  9e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  28.61 
 
 
885 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  34.54 
 
 
642 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.2 
 
 
388 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
516 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.27 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  33.47 
 
 
454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  36.6 
 
 
563 aa  121  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 
775 aa  121  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 
410 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  33.74 
 
 
642 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  33.6 
 
 
364 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0917  serine phosphatase  30.79 
 
 
630 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.92 
 
 
423 aa  121  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.51 
 
 
637 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  30.89 
 
 
445 aa  120  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  33.21 
 
 
630 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.07 
 
 
467 aa  120  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  32.77 
 
 
502 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  32.61 
 
 
462 aa  118  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  34.01 
 
 
467 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  31.17 
 
 
1083 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.31 
 
 
465 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  32.36 
 
 
377 aa  117  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.77 
 
 
393 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.77 
 
 
393 aa  117  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>