More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3736 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3736  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
1017 aa  1957    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
1711 aa  328  4.0000000000000003e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
1361 aa  209  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  40 
 
 
828 aa  207  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
1385 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1390 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1390 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.89 
 
 
1390 aa  194  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  37.47 
 
 
851 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
1370 aa  179  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2087  putative PAS/PAC sensor protein  33.98 
 
 
666 aa  171  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000976195  normal  0.0252685 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34940  fused histidine kinase with GAF domain/SpoIIE-like protein  34.5 
 
 
537 aa  167  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.24735  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
1383 aa  162  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  36.67 
 
 
753 aa  160  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 
1248 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3739  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.64 
 
 
523 aa  157  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.433453  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11395  hypothetical protein  29.73 
 
 
653 aa  157  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2114  anti-sigma-factor antagonist  33.9 
 
 
618 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  40.07 
 
 
693 aa  153  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11810  PAS domain S-box  33.72 
 
 
502 aa  151  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.85834  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.18 
 
 
738 aa  151  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4166  putative PAS/PAC sensor protein  37.65 
 
 
765 aa  151  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.299427  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7089  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  42.06 
 
 
697 aa  150  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0288523  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31980  serine phosphatase RsbU, regulator of sigma subunit  40.51 
 
 
453 aa  148  6e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585203  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0479  response regulator receiver modulated serine phosphatase  42.02 
 
 
529 aa  148  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3855  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.25 
 
 
560 aa  147  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.574477  normal  0.471316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5380  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
890 aa  147  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.622794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  35.83 
 
 
1039 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1895  putative PAS/PAC sensor protein  39.25 
 
 
574 aa  142  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.757129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
792 aa  141  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0524  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 
744 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00695402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2399  putative PAS/PAC sensor protein  41.5 
 
 
700 aa  140  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.249407  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.78 
 
 
1059 aa  139  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  45.07 
 
 
713 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
616 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  35.82 
 
 
697 aa  138  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3140  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 
745 aa  138  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.444013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4478  putative PAS/PAC sensor protein  43.85 
 
 
652 aa  137  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4640  putative PAS/PAC sensor protein  33.67 
 
 
427 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.74459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2252  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
732 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535804  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0433  putative PAS/PAC sensor protein  42.74 
 
 
627 aa  135  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.546697  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.55 
 
 
573 aa  135  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.62 
 
 
817 aa  134  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2140  PAS/protein phosphatase 2C-like  38.78 
 
 
688 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731032  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.8 
 
 
549 aa  134  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2256  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 
727 aa  134  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.903593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3651  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.44 
 
 
727 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2264  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.98 
 
 
525 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
1011 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  38.78 
 
 
692 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5033  putative PAS/PAC sensor protein  37.4 
 
 
760 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4098  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.46 
 
 
1045 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  42 
 
 
770 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4988  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.952168  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  35.08 
 
 
754 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2079  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3089  putative PAS/PAC sensor protein  35.57 
 
 
676 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00620  two-component system sensor protein  38.19 
 
 
1131 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.282271  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3812  putative PAS/PAC sensor protein  43.13 
 
 
757 aa  129  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5311  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.94 
 
 
952 aa  128  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2798  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.01 
 
 
538 aa  128  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  37.64 
 
 
865 aa  128  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4823  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
1004 aa  127  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0743  putative PAS/PAC sensor protein  35.74 
 
 
855 aa  127  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4105  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
888 aa  126  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1882  putative PAS/PAC sensor protein  39.91 
 
 
721 aa  127  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.755669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  29.92 
 
 
642 aa  126  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3071  protein serine/threonine phosphatase  43.65 
 
 
260 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.136695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2966  protein serine/threonine phosphatase  33.68 
 
 
716 aa  125  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.451872  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.88 
 
 
1051 aa  125  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0227  putative PAS/PAC sensor protein  38.18 
 
 
607 aa  125  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.456595  hitchhiker  0.00174766 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4164  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 
688 aa  125  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.412767  normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.37 
 
 
410 aa  125  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1271  PAS:protein phosphatase 2C-like:GAF  39.51 
 
 
585 aa  125  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3606  protein serine/threonine phosphatase  38.13 
 
 
395 aa  125  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  32.42 
 
 
642 aa  125  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4485  putative PAS/PAC sensor protein  38.91 
 
 
547 aa  124  9e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110526  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4619  putative PAS/PAC sensor protein  40.25 
 
 
409 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1588  putative PAS/PAC sensor protein  35.52 
 
 
607 aa  123  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.127314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3356  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  38.68 
 
 
692 aa  123  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223934  normal  0.0312208 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3709  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 
570 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1241  putative PAS/PAC sensor protein  37.22 
 
 
1432 aa  123  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402812 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0750  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 
546 aa  122  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.754604  normal  0.0245877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0401  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 
544 aa  122  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00113041  normal  0.0129071 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  35.86 
 
 
755 aa  122  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  28.14 
 
 
754 aa  121  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
1808 aa  122  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  41.41 
 
 
772 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1009  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  34.98 
 
 
743 aa  121  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2418  protein serine/threonine phosphatase  34.67 
 
 
746 aa  120  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.724517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4019  putative PAS/PAC sensor protein  43.31 
 
 
614 aa  120  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  30.2 
 
 
1171 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1923  stage II sporulation E family protein  35.79 
 
 
511 aa  120  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.963771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  34.08 
 
 
830 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  27.02 
 
 
637 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  27.74 
 
 
775 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  39.3 
 
 
738 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.07 
 
 
1022 aa  118  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2814  putative PAS/PAC sensor protein  38.73 
 
 
709 aa  118  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0793374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  30.81 
 
 
377 aa  118  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>